Basic Information

Symbol
hsa_SPG11_0008900
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa_circ_0103636 hsa_circSPG11_068 hsa-SPG11_0141
Host gene
SPG11
Type of circRNA
Exon-Exon
Location (GRCh37)
15:44876012-44881612 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
15:44583814-44589414 UCSC (hg38)
External Database

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-334.60 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -356.20 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 238.06
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(((.........(((.....))).((((..(((.(((..(((....))).))).)))..)))).(((((((((.((.(((..((((.(.(((((((((..((((((....))))))....(((((.((((.....)))).)))))..((((........))))(((((.(.((((...(((((((((((((((((((((...((((.....((((..((((...((((.........))))...))))..((..((((....)))))).((..(((((.(((.........))))))))..)))))).....)))).))))))..))))))).))))....))))...)))).).)))))..((((((((((.....)))))).)))).......((((((..............)).)))).........(.((((...((((.((((((.((((((((....(((((((....)))))))...((((.(((..((((((((.(((((((((((((.((((((((...((.((.((((((..(((......)))(((((.((((.......)))))))))))))))..)).)))))).)))).)))...))))))).(((((((((........(((((..((((.((...(((.......)))...)))).))..)))))...((((((........))))))....((((((((((...........(((.((((.((.(.(.((((((.((....)).)))))).)))))))).)))...........))))..)))))).....(((((((...((((.((((....(((((((((((((...................))))).))).))).))..))))..))))...))))))).))))))).)).))).)).)))))).))).))))(((.........))).))))))))...........)))))).)))).)))).).))))))))).)))))..))).))))))))))).((((((((...((((....))))..))))))))........)))(((((.(((.(((....))).)))....(((.((((.....)))).)))..)))))
Thermodynamic Ensemble Prediction
(((.........(((.....))).(((((((((.(((..(((....))).))).)).)))),),((((((({{(((.(((..((((.{.(((((((((..((((((....))))))...|{{{,|.|,(({{{{{,,.,..))))}}|{((........))},(((((.(.((((...(((((((((((((({((((((...{(({{{,..,,||}.{(((...({{(.......,,}}},...)))}..{{..{(({....}))}},.{{..(((((.(((......,,.))))))))..}})))),....)))).))))))..})))))).)))),...})))...)))).).)))))..((((((((((.....)))))).)))).......((((((....,.........)).)))).........{.((((...((((.((((((,((((((((....(((((((....)))))))...((((.(((..((((((((.(((.......,...,{({((((.,(({.,,.{{(((((.(((,{{{{{,|{((((({{{{(.{,.,|.))}))))}))))),|,,,||||||}|.}})|||||,|,|||}||},||||||)})}}}}.,,|}}|{((((({(((..({{(.((((((((((,((,.({........)),}.((((((,......,))))))....}}.))}}})))))).)))..)))..|||{((({.(((((((((.((....)).)))))).))).)}))}}.,.)))))))},}}}}),)}})),,..,,,{((((((...((((.((((....(((((((((((((...................))))),}))))}).))..))))..))))...))))))),))))}}}.,,.))).)).)))))).))).))))|,..,,,.....})).))))))))..,,,......)))))).)))).)))).}.))))))))).)))))..))).))))))))))).((((((((...((((....))))..))))))))........)))(((((.({(,(((....}}},))),...(((.((((.....)))).)))..)))))
Forensic Context

No forensic context available.