Basic Information

Symbol
hsa_SPG11_0013300
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa_circ_0103642 hsa_circSPG11_035 hsa-SPG11_0113
Host gene
SPG11
Type of circRNA
Exon-Exon
Location (GRCh37)
15:44884529-44912601 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
15:44592331-44620403 UCSC (hg38)
External Database

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-562.90 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -606.74 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 537.41
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
........(((..(((..(((((((...((((((....))).)))....((((((..(((........))))))))).(((((....)))))..((((...((((..((((((((((..........((((((..((((.(((((.(((((((((((((((.((((((((((((.....))))...((((((..(((.(((...(((.((((((((..(((((((((((((((((((....(((((.(.......))))))..((.(.((((.(((..(((((.(((.....(((((........))))).....)))((((......((((((((((((.......))))))))..))))...))))..((((((.((((((.(((((.........(((......))).....(((..((((.((((.......(((......))).......(((((((.((..(((.....((((.(((((((...)))))))..)))).....))))))))))))...(((((.......)))))..))))))))..)))...))))))))))).)).))))..)))))..))))))).).))))).))))))...)))))))...)))))))))))...))).))).))).))))))...))))))))..((((((((.((((...)))).))(((((...(((....(((...((((((.......((((..(((((((.................(((........)))..........((.(((((......))))).))))))))))))).....))))))...)))...))))))))((((.....))))..((((((((((((.....))))))))))))........((((..(((((((...((((....))))..))))))).))))))))))))))))))).))))).).)))))))))............(((((((((....)))))))))))))))...((((.((((((...((((((...))))))...)))))).))))......((((((((((...))))..((((((......))))))((((((((.((((((((((................)))))((((((....((((..((((((((((.((((((((..((...((((........))))..))..)).))))))..))))))))))..))))))))))...(((.((.(((......))).)).))))))))))))))))....................(((.((((.........)))))))......))))))...((((.((((((.((((((((..(((((((........((((((......))).)))((((((.((.(((((((((.(.......(((((((.(((((.(((.((....(((((........)))))..))))))))))..))))))).......).)))))))))))))))))........................(((((....).))))...........(((((.(((.((....(((......)))..)).))))))))....((((........))))(((((((..((((...))))..((..(((.((.(((((((..(((((((((((........((..((((((((((((((.(((.....)))....((((((((..........)))).))))....((((((((((((((((....((..((((.......((((.................))))))))..)))))))).))))))))))....)))))))).))))))..)).....))))).)).)).)).)))))))))))).))..)))).))).....((.(((....)))..))......(((((((((((((..((((((....))))))....................(((((.((((.(((....)))))))...)))))))))))))).))))((((((((...)))))))).))))).))..)))))))).))))))))))........)))).))))))..)))).)))).)))))))..)))...)))....
Thermodynamic Ensemble Prediction
((((.......))))(..((((.((((((.((((((((....,.{((.(((.((((((((..,.{{..{{{,...({.(((((....}})}}.}}.(((((....})))}..,,.,((((((,,,....,.....|||}}.)))|}}|,||,||,,,,,||,,..{{((.((((.....)))).}}||{{|,|||,||,.{.,,,(((((((.((((((((((((..((((((.(((((((((((({((..,..((((((,,,,...{(({{{{..||,..||||(,(({..,{{{{.,,,,,,,)}}||,,...,,....((({.{{((((((((((((,,,,,,.}}}||||,....,,,,|,,),,)}))},,,||||}.}||||,}}}}}}}.,)})).....|||||,..,...},)))))..}.....{{{..((((((.......))))})..))}.)))))).......))))},..,))))))))))))))))).((((({....})))))...})))))))........)))).))))))).,,{{....}),.)))},,)},)),,.))))))))))).))){{,(((((...((((..(({,((......)))))))))..})))).,,,,...))),})))).)))))).)))){((((((,{((({,.,|,|,|,,,{{,..{(((,.,((((,.,((((,,....,{{({{{..{({{(({........,........||{......,,))).,}},,..,}}}}(((((......|)))}.,}}}}}}}}||,,.....}}},,}...,}},.,)))}|},,,||,.....))),..((((((((((((.....))))))))))))...,,,,,({{{.,{((((((...((((....))))..))))))).))}},,,}}}}})},,,.......{(((...{,(({..(((({{...{((((((((((....))))))))))}...}},.{(((.((((((...((((((...))))))...)))))).)))))))}})).)))}((((...))))..((((((......))))))(((.(((((((((,,,,,(((((..(((((((..((((({((((((....((((..((((((((((.((((((,{..((...((((.,,...,,))))..}}..,,.))))))..))))))))))..))))))))))...,,,.{,.{,{{.,{{{|||{{|.,..,)))),)))))}}.,.....|||||........{{|.((((.......,.})))))}..,....,},}}}}))))))...)))))))..))))}.{((.{{{{{{....{{{.,,.....{|||.,}}{(((((,((.(((((((((.(.......(((((((.(((((.(((.{{....(((((........)))))..}}))))))))..))))))).......).)))))))))))))))))......,},,...,,,........(((({....}.)))).....{{{{{{((((,,....(({({((((.,,.{{{....))},,)))))))}..((((........))))(((((((..((({...})))..((..((,{((.(((((((.,(,(((((((((........((..((((((((((((((.,{{.....}}}....((((((((..........)))),,)))....((((((((((((((((..,..{,,,{{,......{((((..........,.}....)))))}})}}}.)))))).))))))))))....)))))))).))))))..)).....))))).)).)),)..)))))))))))).))..)))).))).....({.(((....)))..),....})))}.,,,|}})}.{(((({{{...,|||||||,,,,..............,(((((.((((.(((....)))))))...))))}||||||,,|,||||((((((((...)))))))).},,}}.,|,,,,}}},}}))))}})})),,,,..})))).)))))))))...,|{||||.,,,}}))}))))))))).))))
Forensic Context

No forensic context available.