Basic Information

Symbol
hsa_SPINK5_0000200
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa-SPINK5_0003
Host gene
SPINK5
Type of circRNA
Intron-Intron
Location (GRCh37)
5:147429869-147431797 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
5:148050306-148052234 UCSC (hg38)
External Database

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-413.47 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -451.94 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 634.29
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
..(((((..(((.((((((.....((((((((((.........((((......(((((((...............................)))))))......))))....((((((((...(((......)))...))))))))........................))))))))))......((((.....))))((((((..(((((((((........(((((((..(((.(((((..(((.(((......................((((..((((((....((((..(((((((..........(((((.((..(((((((((.....(((....((((((.((((.(((((((((......))))).(((..((((.((((.((((..((....))..)))).)))).))))..)))...(((((((((.......((((((.........))))))............((.((((....)))).))................((((((......)))))).(((....)))..............................(((((.((....(((((((.......(((((((((((........(((((((((..((((...((.................))...)))).))))))))).(((((((((((...)))))))))))........)))))))...))))......)))))))..(((.((((...........)))).)))..)).))))).....((((.(.((.((((((((....(((.((.((((.((((((((((........))).)))))))(((((.....)))))...(((((........))))).)))).)).)))..)))))))).))).))))...........)))))))))...................)))).))))))))))...)))...)))).)))))...))...)))))...))))))).))))))))))..)))).(((((((.((......((((((((((((((((.....))).))))))......))))))).....)))))))))..))).)))..))))).))).)))).)))..((((((........(((....)))........))))))..))))))))).)))))).(((..(((((.((..............(((((.(((((.(((.((......)).)))..(((((((((....((.((((((..(((((..((((((((((........)))).........((((((((((((....................((((((((((.............))))))))))......((((((....)))))).(((.((..(((((.(((((((((........((((((((((((((..(((...((((...(((((((((((((((.......))))).)))))))))).))))....)))...)))).(((((....(((((.....((((((((....))))))))...))))).....)))))........))))))))))...........))))))))).)))))..)).)))))))))).))))).))))))..)).))))))))).))..)))))))))..........))))).)))))......)).)))))..)))((.(((((.....)))))))............)))))).))).))))).....(((((.......(((........))).....)))))((.(((((..............(((((..(((((((....)))))))..))))).(.((((..((((......)))).)))).).........)))))))(((((((((...........)))))))))....
Thermodynamic Ensemble Prediction
..(({{,..{((,((((((.,.,,((((((((((....,,,,,,.{(,,,,,,,{{(({,,,{.............{{{{{{{{{{..{{..{||........,{{((.....((({.(({{{(,,.{{...|||.{{{{{(((({...,}},.{{,,.....,,...,,|,,,}}},,}},....{(((.....)))}(((.,,..||||,,,,..,||....||||((({,,(...{(((..({(.{{{,{{{,(,(,(,{,(,(,{,{{{,{,,{{{{,....}))),,,(((({{......||}}}},{({,..,,,{{{{{{,{{{..,..(((,...,{{{{{{({((,{(({{(({,......||,,..({(,,((((,((({.((((..((....))..)))).)))}.}}}}..}}}...{||||{{{|....,||||||||||,.,....,|}}}},...........,({((((....)))).))................((((((......)))))).{({.{,{|||.,{{,,.,{{,......,...........,{||||},,,,,,{,||,||,.,||,..|||}|.,...........{((((((((..((((...((....,......},....))...)))).))))))))}.(((((((((((...)))))))))))..||||.,}}}}}}}}}..,}||....,,}|||},..|||.{{{{.......,..,)})),}}),.,),}}})).....{(((.{.((.(((({{{{,,..{({.((.((((.((((((((((........))).))))))){({((.....|||||...{{{||||,,|||,|,,||.)))).)).))).,)))})))}.))..})))..,,,......}}||}}}||{,,|||||,}}})))})})))}),))),||||}}...,,}...,.,},,|,{((((((((((((((....)),})))).)))))).)}|||}|{{{(((...,,.,,{,,(({{{|||||{{{|||.....,))}))))))|...,,}))}}}}....,})))},,))))},..}))}})),.....|{||{|{{{...((((((........(((....)))........))))))..,.,))),,)})))})))))...))).,.))}})}})}})}.}}}..||||||||}||||,||......}),)))}.))|||,,||}...||.,,||||}},||||..||||||((({........}}}}............,,,{{((((......,,}}},........((((((((((.............))))))))))...}}}.,||..}}}})))))).(((,{,..{((((.(((((((({........(((((((((({(((,,{{{...,{(({,,{{{((((({({((((,,,,,,.}|||||||}}}}))))})}.,...,)))...)}||,{((((.,..(((({.....((((((((....))))))))...}}}))}).}.))))}........))))))})}),,},...,}},))))))))).)))))..}}.)}}}}}}},,.}}}}}.,},||||,||.|}}},}}}}.,,.,)}))))))),....)))))}}.,||||}||.,,,|.||.|||||..,,,.,.{((((.....)))))||,,,.......,,}})))}.}}}.}}}}}.....{{||{,......|||.,......,,,..,..,)))}|.,{{(({..............(((((..(((((((....)))))))..))))).,.{|||,,|{{{.,,,,,)))).}))).},..,.....)))))),(((((((((...........)))))))))....
Forensic Context

No forensic context available.