Basic Information

Symbol
hsa_SPTA1_0001500
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa-SPTA1_0088
Host gene
SPTA1
Type of circRNA
Exon-Exon
Location (GRCh37)
1:158587829-158612766 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
1:158618039-158642976 UCSC (hg38)
External Database
circbank

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-667.40 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -706.65 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 689.92
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(((((((((((((.((((....(((.((....))))).....)))).))))....)))............))))))(....(((.((((((((((((....((((..((.(.(.((((....)))).).).))..))))......(((((((......(((((.(......))))))............(((((.((..((((.....)))).....)).)))))))))))).((((.(.((((....))))).))))(((((((((((((((((((.........)))))....((((..(((..((.((((......(((((((.((.(((..(((..(.......)..)))..))).))..)))))))....)))).))...)))..))))..)))))))..((((((((...))))))))......(((((.(((...((.((((((.(((....))))))))).))))).)))))..((((((((((.(((....(((....)))....))).(((((...((.(((.(((((.(....((...((.((..........))))..))...).))))).))).)).)))))...((((((...(((((...........))))))))))).)).))))))))..((.((((...))))))))))))).................(((((....))))).)))))))))))).)))(((((((...((((...((((((....((((...((((((((.(((...((((((......))))))...(((((((.(((((...))))).))))))).((......))((..(((((.(((((.((.(((((.((((((((((((((......)))))..))))))...((((.........)))))))))))).)).((((((.(((((((((((((..((((((((....)).))))))...(((((...)))))(((((((((((((.........))))....((((..((....(((....((((.(((...)))))))...)))....)).)))).............))))))))).((((((.((.(((((.(.(((((((...((.(((((((((((((((.....))))...))))))((...(((((......)).)))....)).))))))).))))))).).)))))((((((((((.(((.....))))))....((((((((.((........))..))))))))........((.(((........))).))))))))).((....)).....)).))))))))))))))))))).....((((.(((((((((........))))))))))))).((((..(((((((.....((....))....)))))))....))))..(.(((.(((....)))))).)...))))))......((((((...((((....))))..)))))).((((.(((((((((((((..(.........(((((((.((.((....)).))...)))))))............(((((((..(((......((((((......)))))))))..)).)))))...)..)))))))))).))).))))((..(((.((.....)))))..))..))))).)))))..))((((((((((.(((..(.(((.......))))..))))))))))))).....))).))))..................(((.(((..(((((...((((.....(((.(((((..(((.((....)).))).......((((.((....)))))).((((((..(((((.(((((((.......))))))).))))))).))))(((((....((.((((((...(((((((((((((....(((.....)))..)))).))))).))))))))))..))....)))))...))))).))).))))..)))))..))))))(((((((..((..((((.(((...........))).)))).((.((((.....)))).)).))..)))))))))))...)))).....))))))))))...))))))).)
Thermodynamic Ensemble Prediction
((((,,,((((((,{(((....{{{.||,,.,)))}}.....|}||,|}}}....,)),,.|,......,||||,|(,,,.{(,.,.||,{{|||,|}}},((((..((.(.(.((((....)))).).).))..))))......(((((({,...,.(((((.(......}}|}},....,,|..,..((({(.{{.,{{{{.,,,.}}}}}},.,||,))}}}}))}))).((((.{.((((....)))}).)))){(((((({((({(.{({((,,,,..,,,||||},{,{(((({{,{,...(((((({(((..(.(((((..(((((.((((((..((({..,......,|,..{{,.|||..{((,({||,,|,}},.,.)}|,)))..,.....,..((((((({...})))))))((({{.(((((.{((...((.((((((.(((....))))))))).))))).)))))...{((...}}}.(((,{..(((....))).}}.))).}}}}}.})))..)))))).)))))..))))))..))).......}}))))}..,..})})))}|||||,(({{,{{{{{{(((({{.,.(((((...........)))))})}}}).}}|}}|||,}}},,|}||,....,}}||{|||||}}............,|...{((((....))))).))}}}}||||(((((((((({...,...{||,.||||}},...}}|}...,{{,{{{{.{{{,..((((((......))))))...(((((((.(((((...))))).))))))).{(......}}({..{((((,{((((,{(.(((((.((((((((((((((......)))))..))))))...((((.........)))))))))))).)},({((({.{{(((({((((({,.(((((({{....,},)}))))...{{{((...|||||((({,,{|||,{{,|||||..,||||{{{..{{{,,{{....{(({({.,{{.,|||}..,}))),)},.|}},,,,||||||||,.......,...}))))}}}},||||||.,,.{((((.(.(((((((.,,{({(,,{(((((((((((.....)))}...)))))}||....{(((,,,...}|||,|,..,||,,}|||||.}}}}}}),),)})}|(((,,,{{{{||||.....,))}))}.,.(((((|||||{........},,,)))))))).....,,.((.(((........))),)}))))))}||||..||}..,,,)),)))}}|})}}))}}|||}}...|.{(({.(((((((((........)))))))))}})},|(((..(((((((.....((....))....)))))))....)))}.,.,({{.(((....)))})}}),,,}))))).}}},.((((((...((({....})))..)))))).{(((.(((((((((((({..{,,.,|||{{(((((((.((.((....)).))...))))))).,,,...,,,..{((((,{..(((......((((((......))))))}}}..||,|||)),,.).,))))))))))||)}.)))}((,,({(,(({....}||||..,,..))))}.|||}}..}}{{((((((((.(((.,|.(((.,...,.))),..))))))))))))).....}))})))),,...,..,,,,,....,|||}|||,,|||||,},||||,}|||||{,{{{,...}|||||}|}|}},|||||.{{....)).)))),}||||}}.((((((,.{((((.(((((((.......))))))).)))))}).))))(((({...,{|,((((((...(((((((((((((..,.(((.....))),,)))).)))))))})))))))}..)).,,,)))))...)))})}}}}.,)})..))))).}))))}..{((,{{,((({.,{{{.{((,.{,,,{||{{,,,.},)),||,}|||,..,.,,,))))..}.}))}}}}}}}.}))}}|||||...}))))},}}.,}}))))),)})
Forensic Context

No forensic context available.