Basic Information

Symbol
hsa_SPTA1_0003300
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa-SPTA1_0012
Host gene
SPTA1
Type of circRNA
Exon-Exon
Location (GRCh37)
1:158604333-158612332 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
1:158634543-158642542 UCSC (hg38)
External Database

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-292.50 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -311.86 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 164.48
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(((.....))).........(((((.(((((.((..((((.....)))).....)).))))).)).)))........((((....))))...((((((((((((((.(.(((((.........)))))..).))))..(((((.((((((((((..(.(((((..(((((.((((((..((((..............(((.(((..(((.(.....).)))...))).)))...........((((((((...))))))))(((((.(((((.(((...((.((((((.(((....))))))))).))))).)))))...(((...))).(((....(((....)))....))).))))).))))..)))))).)))))..))))))..))).....((((((.(.(((.(((.(((((((((((((((((((((((((((...(((((...........))))))))))).(((.(((((((..(((.((((((((((((((((((.((...............(((((....)))))...(((((((((((....(((((...((.((...((((......))))....)).)).........((((((......))))))...(((((((.(((((...))))).))))))).((......))))))))))))))))))((.(((((.((((((((((((((......)))))..))))))...((((.........)))))))))))).))...((....)).))))))))).)).)))))).))).))).))))))).)))....((((((((....)))....)))))..))))))))..))))........(((((.....)))))...)))..)).)))).)))))).).))))))...........)))))))))).)).....((((....))))...))))).))))).
Thermodynamic Ensemble Prediction
(((.....)||.........(((((.(((((.((.,((((.....)))}},...)).))))).)).))).......,{(({....)))),.|((((((((((((((.(.(((((.........))))).,,.))))..{(((,{((((((((({..(.(((((..(((((.((((((..((((.........,{,..{{{.(({..((({({,,,.|.}}}...}}|.||}...........{{{{{{||...}))}))))((({{.(((((.{((...((.((((((.(((....))))))))).))))).))))),..{({...))).(((,{..(((....))).}},))).)}}},.))))..)))))).)))))..)))))}..}}}.....((((((.(.(((.(((.(((((((((((((((((((((((((((...((({(...........))}}))))))).(((.((((((,..(((.(({(((((((((((((((,,,,.........,{{,.(((((....))))).}}|({{((((((({{{{(((,,....,..},..||||}}}.,,))}}....||....,...,...((((((......))))))...(((((((.(((((...))))).))))))).,{.....,,|||,,,)))))}}}}}}{(.(((((.((((((((((((((......)))))..))))))...((((.........)))))))))))).)}...{{....)).}})))))))},).)))))).})).))).})))))).)))....((((((((....)))....)))))..))))))))..))))........{((((.....)))))...))),.)),}))).)))))).).))))))...,,....)))))))))))),,}.....{(((....}))),..))))).)))))}
Forensic Context

No forensic context available.