Basic Information

Symbol
hsa_chr1_0234900
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa-SPTA1_0154
Host gene
SPTA1
Type of circRNA
Intergenic-Intergenic
Location (GRCh37)
1:158606650-158607706 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
1:158636860-158637916 UCSC (hg38)
External Database

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-238.40 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -261.68 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 401.32
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
((((((((((((..((((((((......((((.......))))........(((((((((.(((((((((((......((.((((((.(..............((((...)))).........).)))))).)))))))..)))))))))))))))...........((((...(((((((((...(((.(((((((....((((((((.(((.(((((((((((........))))..........(((((....)))))((((((((..((((....))))..))))))))..((((((...............))))))....))))))).))).(((.((((((...)))))).)))..(((((((.(...(((..(((((..(((((.(((((((...((((.((((((((........)))))))).))))....)))))))...)).)))..)))))...(((((.(((.((((((((.((((.....(((((((.......))))))).........)))).).))))))).)))..))))).....((((((((.((((..((......)).))))...))))))))..((.((((((......)))))))).)))....).)))))))((((((.(((((((..((((((.((((.(((((..........(((......)))))))).)))).)))))))))))))))).))))).)))))).(((....)))..))))))).)))......((((((((((((..((((((......)))))).)))...)))))).)))))))))))))))))))))))).))))((((((((..((.(((((((...((((((....)))).))...)))))))))..)))..)))))..((((((...(((.(((((.................)))))...)))....))))))))))))))(.((....((((((.....((((.........(((((.(((((((...........)))).)))..)))))))))))))))....)).)
Thermodynamic Ensemble Prediction
((((((((((({,.,,,,{{{{,,,,..((((,,.....}||}........{(((((((({(((((((((((......{,.(((({(,{..............{{{{...}}}},.,,,....,.}))))}.}}))))}..}))))))))))))}},,,.,{((({(,{{{{,{{{{,{{({,((((((..((((({,{,,.{,,.....,||,|{{{{{({{,,......,,|||||,,.,.,,..(((((....))))}{(((((((..((((....})))..))))))))|,(({{{{.,,,|},,,,.},,,))}})),...)}})))),}},,(((.((((({...}))))).)))...,||,},|{|||||{..(((((..(((((.(((((((...((((.((((((((........)))))))).))))....)))))))...)).)))..)))))||,{{{{{,|{|}||||||{|||{{,.....(((((((.......))))))),.,......)))},),))))))),},)||))))).....,((((({{,{(({..,,,,,,,.,|.||||{{{,|||||,,..{{{{{{{{{......}}}}}},,,})},....}))}.))}||||{||||{{|{{..{{{{{,.{{{{|{((|,...}},|}|||{{,,,..,|||||,||{|||{{{((((,,|,,|))))).{{((((({,,,..(((....}))..,.,,,......,|||||}},(({((({,({,.,||||,.}||,}}}|}},..|{{{||{{({......}}}}}}))})))|||||||.|}}}||||}},,.}))))},}}..})))))))}))))),})}))}}})))}},,,},,})},,}|,,,,,((((((,,,({({({{{{..,...,.,,,),..,}))),)}}}}}},...)))})}.}))))))|.|,,}}}|||||{{{.{{{{,{{{{..}|||{{|||}|,,{(((...........)))|,|||..|||||.,,)))))}}),))}),)
Forensic Context

No forensic context available.