Basic Information

Symbol
hsa_SPTA1_0014700
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa-SPTA1_0037
Host gene
SPTA1
Type of circRNA
Exon-Exon
Location (GRCh37)
1:158644119-158656327 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
1:158674329-158686537 UCSC (hg38)
External Database

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-255.70 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -270.05 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 187.98
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
((((((..((....)).....))))))..(((((........(((((((.....))))))).(((((...))))).(((..((..((((...((.((..(((((((.((.((.((((((.........(((((((...(((((((...(((((..(((((...(((((((((((..((.....))..))))))))))).........((((((((......)))))))).((((..((((..((((((..(((((((((((.((.((..............(((((((.................)))))))..(((....)))...............(((((((((..((((.........(((.((((.((((((...)))))).)))).))).((......))..(((((((.((((..((....))..))))(((((..((.((.(((.(((.(((((.((.((.........)).)))))))...)))..))).))((((...))))..(((........)))))..)))))(((((((.....(((((........)))))(((((((((((.((((((.(((((....(((.(((((....)))))..)))....)))))...)))))).)))...(((....(((......)))..)))........))))))))....)))))))......((((........))))))))))).((((((.((((....))))))))))..)))))))))))))....)).)))))).)))))))..))))))))))))))....)))))..))))))))))))..))))))))))))).)).)).)).)))))..)).))....))))..))..)))..)))))..
Thermodynamic Ensemble Prediction
((({{,|||((((.{{.....{{{{|,..{||||}..,,...(((((((.....))))))).||||,}}}}}|}||{{{..((..((((.,.{{.((..(((((((.((.((.((((((.........(((((((...(((((((...(((((..(((({...(((((((((((..((.....))..))))))))))).........((((((({......}))))))).({({.{((((,.,(((((..(((((((((((.,{.,,.,,,..........(((((((..........,..,...)))))))..{{{{,{{|||,.......,,..{{{,,,,|||||,,((((.........(((.((((.((((({...}))))).)))).))).{,......},..{{,{(({.((((..({....})..)))){(({,..{{{((.(((.(((.(((({{((.((.........)).)))))))...)))..))).))}|||,,}||,,..(((........)))|}.{|||}}{{||||{.,...(((((........)))))(((((((((((.((((((.(((((..,.(((.{((((....))))}..))).,..)))))...)))))).))}...{((,...{{|,.....)))..)}).,,....,)))))))),)}}))))}}}....{{((((.........))),)))))).((((((.((((....))))))))))..}}}||||}},,,,....))}).)))).)))))))..)))))))))))}))....)))))..))))))))))))..))))))))))))).)).)).))},))))..)).})....))))..))..}))}.)},},,,
Forensic Context

No forensic context available.