Basic Information

Symbol
hsa_SPTA1_0014900
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa-SPTA1_0065
Host gene
SPTA1
Type of circRNA
Exon-Exon
Location (GRCh37)
1:158645931-158653286 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
1:158676141-158683496 UCSC (hg38)
External Database

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-250.90 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -265.95 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 183.84
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
((((....(((((.......((((((.((....((((((((.......(((.(((....))))))..............(((.((((.((((((...)))))).)))).)))........((((((((....((((..(.((...)))..))))(((.(((((.((...((((((((((.....)))))...))))))).))))))))....(((((.((((((((((((....)))))...((((((((..(((((((((...((((.(((((((((..(((..((((((((.((((.............))))..)))))))).........(((........))))))..))).))))))......((.(.(.((((((..(((......)))..)))))).).).)).((((......)))).......))))..)))))))))..)....))))))).)))))))...)))))))))))))(((((...(((((...((((((....))))))....................((((((....(((((.(.......))))))..))))))..)))))..))))).((.((((....)))).))...(((((........)))))(((((((((((.((((((.(((((....(((.(((((....)))))..)))....)))))...)))))).)))...(((....(((......)))..)))........))))))))))))))))...)).))).))).........)))))))))((((((((.((((....))))))))))..((.((((..........)))).))........))
Thermodynamic Ensemble Prediction
((({....{({{{..,.{,.{{{|{(,{{.,|.((((((((.......{(,{(((....)))))},,(({.........(((.((((.((((({...}))))).)))).)))........{{{{((((,{,.{{((.{(.((...))}.,))))|||.|||((,{{...|||({(((((.....)))))..,))))}||,|}||||}}....||||||||{(({{(((((....)))))..,|{{((((({.(((((((((,..,(((.(((((((((..(({..((((((((.((({....||,,.,,}.)}}|,,|}||||}}...,,,..||||....,,}}}},)))..))),})))))......((.(.(.((((((..(({......)))..)))))).).).)).((((......))))..}}}..}))),})))),))))}},....}||||||,}|||}}||||||||||||}}}}}|||{{.,}||{||,|.((((((....)))))).......,............((((((....(((((.{......,})))))..)))))).,||}},..,,,)),||.{|||,,,,}}}}..}...(((((........)))))(((((((((((.((((((.(((((..,.(((.{((((....))))}..))).,..)))))...)))))).))}...{((,...{{|......)))..)}).,,....,))))))))))))))))...,,,}||,|||.,..,....)))})))))|,((((((.((((....))))))))))..((.((((..........)))).))........})
Forensic Context

No forensic context available.