Basic Information

Symbol
hsa_SPTA1_0015300
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa-SPTA1_0067
Host gene
SPTA1
Type of circRNA
Exon-Exon
Location (GRCh37)
1:158647480-158655137 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
1:158677690-158685347 UCSC (hg38)
External Database

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-136.70 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -148.46 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 118.13
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(((.((((((((...((((((....(((((((..............)))))))(((((((((((.((((((((((((.(.((..........))).))))))((((((((((((.((..(((((((((((..((.....))..))))))))))).........((((((((......))))))))((.(....(((...(((((.....)))))....)))...)))..........(((((......)))))..))))))))..)))))).................)))))).))))...)))))))..)))))).))))))))..((((((....))))))...((((.............((((((....(((((.(.......))))))..)))))).(((........)))((.((((....)))).))...))))..)))((((((((((((....((((((...))))))...))))...(((.((........)).)))...))))))))
Thermodynamic Ensemble Prediction
(((.((((((((.{{,,{((({,..,||||}...,..}......,,.(((.(({((((((((((.(((((({(((((.{.,{..........,}},)})))){{{{((,{(((({,,..(((((((((((..((.....))..))))))))))).........((((((((......}))))))),{......({,...(((((.....)))))....}}}.,,)))..........(((((......)))))..,}}}}}}|..|}}}}}....,|....,,}}}}.)))))).))))...)))))))).)))})).)))))))},.((((((....)))))),..,||||,...,,,.,...((((((....(((((.{......,})))))..)))))).(((........)))(,.((((....)))).,)...|}}|..}))((((((({{(((....((((((...))))))...}}}},|.{(({(,...}}}}.}},))}.,.))))))))
Forensic Context

No forensic context available.