Basic Information

Symbol
hsa_SPTA1_0015400
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa-SPTA1_0068
Host gene
SPTA1
Type of circRNA
Exon-Exon
Location (GRCh37)
1:158647480-158656327 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
1:158677690-158686537 UCSC (hg38)
External Database

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-150.80 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -162.88 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 114.93
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(((((...(((((.(((((..........)))))))))).....((((((.((.(((((((((((((..(((((.......))))).....(((.((.((((((((((.((((((((((((.(.((..........))).))))))((((((((((((.((..(((((((((((..((.....))..))))))))))).........((((((((......))))))))((.(....(((...(((((.....)))))....)))...)))..........(((((......)))))..))))))))..)))))).................)))))).))))...)))))))).)))))))))))......((((((....))))))....)))))...))))))))((((((....(((((.(.......))))))..))))))........)))))((((((((((((...))).....(((((........)))))(((....((((((...))))))...)))(((.(((((....)))))..))).))))).)).))
Thermodynamic Ensemble Prediction
(((((...(((((.(((({..,.......)))))))))).....((((((({{.(((((((((((({..{((((.......}}}}}.....(((.(({((((((((((.(((((({(((((.{.,{..........,}},)})))){{{{((,{(((({,,..(((((((((((..((.....))..))))))))))).........((((((((......}))))))),{......({,...(((((.....)))))....}}}.,,)))..........(((((......)))))..,}}}}}}|..|}}}}}....,|....,,}}}}.)))))).))))...)))))))).)))))))))))..,.{.((((((....)))))),...)))))...))))))))((((((....(((((.{......,})))))..))))))........)))))((((((((({{(,.,|||.....(((({....,.,.}}}))||{,..,((((((...))))))...,}}(((.{((((....))))}..))).)))))}}),})
Forensic Context

No forensic context available.