Forensic RNA Knowledge Base

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.

Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.

Minimum free energy

-173.10 kcal/mol

Thermodynamic ensemble

Free Energy: -185.44 kcal/mol

Frequency: 0.0000

Diversity: 183.72

MFE Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

((.(((.((..(.(((((((....(((((.......((((((..((((((((.((..(((..........(((((((.(.((..........))).)))))))((((......))))..(((((((((((..((.....))..)))))))))))..(((((..((((((((......))))))))........(((...(((((.....)))))....)))...(((............)))............)))))..(((((((..(((....)))........(((.(((....))))))...........)))))))...)))..)).)).)))))).)))))).......)))))...)))))))......)..)).))).))((..(((.(((((.((...((((((((((.....)))))...))))))).))))))))...(((((((((.............(((((((..((((((..(((...(((....)))....))).((((..((....))..))))....)))).))..)))))))((((.((((.....)))).))))......(((....)))))))).))))......((.(.(.((((((..(((......)))..)))))).).).)).))

Thermodynamic Ensemble Prediction

{(,(((..,,{(.(((((((....(((((.......((((((..((((((((.((..((({......,,{{((((({,(,{(...,,{,...|||,|}}}}}}{({{...,.,||}}..(((((((((((..((.....))..)))))))))))..|||||..((((((((......))))))))......,,|},.||{(||,...,.}},||{{{.{{{...(((............})),.....))}..})),))..(((((((..(((....)))........((,{(((....))))))..,........))))))).,.,)).})).)).)))))).)))))).......)))))...)))))))...,.,,.{||{}||,,|((,|(({.(((((,{{...{{{({(((((.....)))))...}}|||||,|}}|}|||,...,((((({{.((..(((((....)))))..)){(((......))}}}}}}}.}.,}}.}})}.}}||,,|.,,.{{{{,|({,({{,...,|||,,||}.}}}|{{|}||||,}...}},,.}}}}..,.|||||..,}..|||}}}.))))......((.(.(.((((((..(({......}))..)))))).).).)).,}

Basic Information

Secondary Structure

Structure Prediction

Forensic Context