Basic Information

Symbol
hsa_SPTA1_0016500
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa-SPTA1_0146
Host gene
SPTA1
Type of circRNA
Exon-Exon
Location (GRCh37)
1:158651317-158655137 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
1:158681527-158685347 UCSC (hg38)
External Database

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-134.60 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -144.45 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 110.24
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
((.(((.((..(.(((((((....(((((.......((((((..((((((((.((..(((..........(((((((.(.((..........))).)))))))((((......))))..(((((((((((..((.....))..)))))))))))..(((((..((((((((......))))))))........(((...(((((.....)))))....)))...(((............)))............)))))..(((((((..(((....)))........(((.(((....))))))...........)))))))...)))..)).)).)))))).)))))).......)))))...)))))))......)..)).))).))(((((((.(((((.((...((((((((((.....)))))...))))))).)))))))).....(((((...((..(((((....)))))..))((((......))))))))))).))
Thermodynamic Ensemble Prediction
((.(((..,.,(.(((((((....(((((.......((((((..((((((((.((..((((......,,{{((((({,(,{(...,,,,...|||,|}}}}}}{({{...,.,||}}..(((((((((((..((.....))..)))))))))))..|||||..((((((((......))))))))......,,|},.||{(||,...,.}},||{{{.{{{...(((............})),.....))}..})),))..(((((((..(((....)))........((,{(((....))))))..,........))))))).,.,)).,)).)).)))))).)))))).......)))))...)))))))......,.,)}.))).))(({{(((.(((((.((...((((((((((.....)))))...))))))).)))))))).....{((((,,,((..(((((....)))))..)){(((......))))}))},}),})
Forensic Context

No forensic context available.