Basic Information

Symbol
hsa_AP4S1_0000200
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa-STRN3_0124
Host gene
STRN3
Type of circRNA
Intron-Intron
Location (GRCh37)
14:31495106-31495535 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
14:31025900-31026329 UCSC (hg38)
External Database

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-238.70 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -243.61 kcal/mol
Frequency: 0.0003
Diversity: 66.09
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Forensic Context

No forensic context available.