Basic Information

Symbol
hsa_COCH_0001600
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa-STRN3_0229
Host gene
STRN3
Type of circRNA
Intron-Intergenic
Location (GRCh37)
14:31363880-31364577 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
14:30894674-30895371 UCSC (hg38)
External Database

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-144.00 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -157.23 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 175.07
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
((..(((......)))...))(..((((((..((.(((....))).))(((((.(((((((.((((.(((((((((((((((..((.((.....)).)))))))))))).(((.((((....))))))).....(((((......)))))))))))))))))))))......((((((.(((.....)))))))))...(((((((((.((((((((((((((((((((((((((.((((.......)))).....(((.((((((((........(((.........))).(((((((..(........)..))))))).((((..............))))........(((........)))..)).)))))).)))..............)))))))))))))))))))))))))).((((((......))))))((((((...(((((((...((((((.............(((.((.......)).)))............)))))).......)))))))..))))))(((((...)))))...............)))))))))......((((((((..((((((((............((((((....((.....))....)))))))))))))).))))))))((((((........))))))(((....))).))))))))))))
Thermodynamic Ensemble Prediction
{{..(((......)))...||(,{(({{{{..({,(({.,..|||.,}(((((.{({{{{{,{((({(((((((((((((((..((.((.....)).))))))))))))}(((.((((....))))))).....{({{{......}}}}}.,|,,,}||,}}}},,......((((((.(((.....))))))))).,,|{{{{{{{,.((((((((((((((((((((((((((.((((.......)))).....(((.((((((((........,,...........,,.(((((((..{........,..))))))).((((..............))))........(((........)))..)).)))))).)))...........,,,)))))))))))))))))))))))}}||{{((({,.....}))))}((((({...(((((((..,((((({.............{{{.{{.......}}.))}........,}..})))))....,..)))))))..)))))){{{{{...})))}.....},..,,,}.,}}}}}}}},.,,...((((((({..((((((((............{(((((....{(.....}}....)))))))))))))).)))))))){(((((........)))))}{|{..,,))).))))))))))))
Forensic Context

No forensic context available.