Basic Information

Symbol
hsa_STRN3_0020700
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa-STRN3_0038
Host gene
STRN3
Type of circRNA
Intron-Intron
Location (GRCh37)
14:31485093-31487257 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
14:31015887-31018051 UCSC (hg38)
External Database

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-1007.50 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -1040.79 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 389.84
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
((.((((((((((((((.........))))))))))..))))))(((...(((((((((((((((((..((((..((((..(.((((((((((((.(((((((((...((((((((..(((....((.((((.((((((.(((.((((((((((((((.....((((((((.((((((((..........))))).....))).))).)))))(((((......))))).....)))).))))).)))))..(((((((((.....((((((((.(((....))).))))))))(((..((((.....(((((((..((((((((.(((((......((((((.......((((....)))).......))))))...((((((((.........(((((.......)))))...((((((...((((((((.((((.....)))).))).))))).))))))(((......))).((((......))))....(((..((((((........))))))..)))((((....))))..............(((((((((((((((((((..((((((((((.((((((((((((((((((((((((((((((((((.((((((((((((((((...((.((((((((((((((((.((((.(((((.(((((.(((((((((..((((.((((((.(((((((((((.(((((((((((((((((((.((((((((.((((.((((((.(((((((((.((((((((((((((((((((((((.((((((((((((((((((((((((((((.((((((((((((((((((((((((((((......)))))))...(((((....)))))......((((..(((((((((.....((((((...))))))((((((((...((((((.((((((((.........)))))..))).))))))))))(((.(((((.(((((.......))))).)))))...)))((((((((......(((....)))......))))))))...................)))))))))))))..))))......(((.(((((((((((....))))))))..))).)))(((((.(((((.....)).))))))))..((((((.(((...)))))))))((.....)).(((((((....))))))).....))))))))))))))))))))).)))))))))))))))))))))))))))).)))))))))))))))))))))))).))))))))).)))))).)))).)))))))).)))))))))))))))))))))))))))))).)))))).))))..))))))))).))))).))))).)))).))))).))))))))))).))...)))))))))))))))).)))))))))))))))))))))))))))))))))).))))))))))..)))))))))))))))))))((((((....))))))...........))))))))................))))))))))))).....((((((.((((((((((((((((((((.(((............)))...)))))))))..............))))))))))).)))))))))))))......))))))).........))))).))))..............(((((((((..((((((((.((((....(((..(((...(((((......))))).)))..)))...))))...)))))))).)))))))))..((((((..((((.((((......)))).)))).))))))...........(((((((((((((..(((((((.(((((...((((((......)))))).....))))).)))))))..)))(((((..(((((((..(((((..(.(((((.((((.((..((((((((((.(((((.............))))).))))))))))........))))))))))).)..)))))))))))).))))).........))))))))))))).)))))))))).))...)))..)))))))).)))..)))))).))))))))))))).)).))..))).)....)))))))))))))))))...)))
Thermodynamic Ensemble Prediction
((.((((((((((((((........,))))))))))..))))))(((...(((((((((((((((((..,((({.((((.,,.((((((((((((.(((((((((...((((((((..(((....,,.((((,(((((,.({(.((((((((((((((.,,..((((((((.((((((((.,....,...))))).....))).)))}}))))(((((......)))))...,,)))).))))).))))|,.{((((((((,....((((((((.(((....))).)))))))).....{,,,.....,{|{{{|}}||||||{,.,{{{,......||{|||}}}},},((((....))))......{{|||||{..,(((({{,.,{{.{{{{((,,,.{{{{.{|||||..,((((((,..((((((((.((((....})})).))).))))).)))))}}.{{{{{{{{{..,,,,.{{{,,{{{|,{{{{{{,.{{(((({{....{{||||||.....{{{{....))}}..............,((((((((((((((((((..((((((((((.((((((((((((((((((((((((((((((((((.((((((((((((((((.,.((.((((((((((((((((.((((.(((((.(((((.(((((((((..((((.((((((.(((((((((((((((((((((((((((((((.((((((((.((((.((((((.(((((((((.((((((((((((((((((((((((.((((((((((((((((((((((((((((.((((((((((((((((((((((((((((......)))))))...(((((....)))))..,...{{{{..{{{{{{{.,....,((((((...)))))),,{{({{,.,,((((((.(((({(((,........}}))),,))).)))))).}..{{{.((({{.(((((.......))))},||}}}...)))((((((((......(((....)))......))))))))...,,,{,.,,,.....}}})))))))}}}}|,.}}},.}|,||(({{(((((((((((....)))))))),,},,.))){{{({|((({{.....}).))))))))..((((((.(((...)))))))))((.....)).{((((({....})))))}.....))))))))))))))))))))).)))))))))))))))))))))))))))).)))))))))))))))))))))))).))))))))).)))))).)))).)))))))).)))))))))))))))))))))))))))))).)))))).))))..))))))))).))))).))))).)))).))))))))))))))))).))...)))))))))))))))).)))))))))))))))))))))))))))))))))).))))))))))..))))))))))))))))))|{(((((....}))))),..........,,,|||||{{{|||||{,,.....,|||,|}||||||,||,.((((((.((((((((((({{{{(((((,|.{,,..{,...,,|||,...)))}}}}}},,|||..,,,,,..))))))))))).)))))),}}}},,....,,))))}}}.........,,})).))}),,.}}}}}}}}}..,((((((((..(((((((({{(((...,(((,,(({.,.{{{{{...,,,))))).,,).,)))...}}}}...}})))))).)))))))))}}||))....}))|}|{{,.}}}},)}})})))},))))))}}},.,}}}}}||||||||||.||},|||{{{{.{||||,,,|(((((......)))))}.....}||||,}}}}}}}..}},,||||,.(((((((..(((((..(.(((((.((((.((.,((((((((((.(((((.............))))).))))))))))...,,,,.}}))))))))).)..)))))))))))).,}|||{{{,,,.,,|}}}}}},,,,}),)})))))))),.....)))..)))))))).))}.,)))))).))))))))))))}.}).)).}),}})}}..)))))))))))))))))...)))
Forensic Context

No forensic context available.