Basic Information
Symbol
hsa_SYT16_0003100
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa_circ_0102341
hsa_circSYT16_007
hsa-SYT16_0017
Host gene
SYT16
Type of circRNA
Exon-Exon
Location (GRCh37)
14:62536321-62567425
UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
14:62069603-62100707
UCSC (hg38)
Secondary Structure
Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-470.80 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy:
-495.67 kcal/mol
Frequency:
0.0000
Diversity:
290.58
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(..((((((((..(.....)..))))))))..)(.......(((.(.((((.((((((..(((((...))))).)))))).)))).).)))((...((((((.((((((((((((((.(((((.((((.((((((((((((.((.(((.......))).))........((((((.((((..((((((((((((((....))))..)))...(..(((.((((((((.(((((((((........((((...))))....(((((((.(((((...(((((((((..(((((.......)))))..)))((((((((.........))))..)))).(((((.((((..(((((......(((...)))......)))))..))))..)))))(.((((((..((((.(((...((.(((((((....)))))))..))...))).)))).)))))).)...((((.........)))).(((((........))).))...((((((....(.((((.((((......(((((.((((....(((....)))...))).).)))))(((((.((((((((((....))))))))(((((..(((((........))).))......)))))..)).)))))......((((.((.(((((.((((((.....)).))))))))).))..))))...)))))))))..))))))....))))))...))))).)))))))...((((.((((.(((((((((((((..((((((((.(((.((((......((((..((((....(((((((((.(((...((((........))))))).))))..((((.(((.(((....)))............(((((((((....)))).)).))).......))))))).)))))))))..))))......))))........))))))))))).........)))))))).)))))......)))).)))).)))))))))..))))).))).)))..)..(((((((((.........((((((((............)))))))).......(((........))).((..........))....(((((..(((.((....)).)))..)))))..))))))))).....))))..)))..))))))))))))))))))))))..........)))).)))))))))))..((((((((.((((((((..(((..((((((.((((((((((.....((.....))...)))))....))))).))))))..))).(((...)))))).))))).).)))))))..........)))))))).))))))...)).......(((((((((((..(((.....)))...))))))))...))).)
Thermodynamic Ensemble Prediction
(,.((((((((..{.....)..))))))))..,{......,||(.{.((((.((((((..(((({...})))).)))))).)))).,{|||({...((((((.((((((((((((((.(((((.((((.((((((((((((.((.{,.,{{.....{{,({{(((({,{((,{{{,.}|||.|,.,|||||,((((....}))),{{{{,..{,.{((,((((((((.(((((((((.....,,.({(,.,,|}||,...(((((((.(((((...(((((({{{..{{{{{.,,,,,.}}}}}..)})|||||(((.....,,.,|||,(((((,.(((((.((((..(((((......(((...)))......)))))..))))..))))))))))(((,,.{{{......,)),|{{{{||,,..}}})))}...((.(((...(((((.......))))).))).))....|||..(,(((........))).),.}}|(((((....(.((((.((((...,,,(((((.((({....(((....)))...))).),))))}(((((.{{((((((((....))))))))(((((..(((((........))).))......)))))..}}.)))))..||,,{{{{.((.(((((.((((((.....)).))))))))).))..)))),,.)))))))),..)))))),}},))))))...))))).)))))))...((((.{{{{,(((((((((((((..((((((({,(({.((((..{,..((((..((((....(((((((((.((({,,,{((........))))))).))))..((({,(((.(((....))).........,,.(((((((({....})))},),,)).......))))))).)))))))))..))))..,,..))))........))))))))))).........)))))))).)))))..,,,,)))).)))),)))))))))..))))).}}}.}},.,}..{{{((((((|,,..,,,.|(((((((............)))))))}....,||(,|,...,.}}))).,|,,,.......||,...(((((..{((.({....}).)))..))))).,)))))))))....,||||,,.,,}}))))))}.))))))))))))))..........)))).)))))))))))..((((((((.((((((((..{((..((((((.(((((((((({{{,,.,..,,..)}},}))))....))))).)))))),,)},.(((...)))))),,)))).,,))))))).,........)))))))).))))))...))..,}}..(((((((((((..(((.....)))...))))))))...))).)
Forensic Context
No forensic context available.