Basic Information

Symbol
hsa_TCF20_0002400
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa_circ_0116673 hsa_circTCF20_003 hsa-TCF20_0008
Host gene
TCF20
Type of circRNA
Exon-Exon
Location (GRCh37)
22:42609777-42610247 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
22:42213771-42214241 UCSC (hg38)
External Database

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-133.10 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -142.51 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 48.41
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Forensic Context

No forensic context available.