Basic Information

Symbol
hsa_TCF20_0001300
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa-TCF20_0042
Host gene
TCF20
Type of circRNA
Intron-Intron
Location (GRCh37)
22:42571726-42572802 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
22:42175720-42176796 UCSC (hg38)
External Database

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-345.10 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -364.52 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 336.38
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(......)((((...(((.(((((((......((.(((...............))).))(((((....(((.((((...))))....)))....))))).(((((....)))))(((((.....((((((..........)))))))))))(((((((((((((((.((.((.((((((..(((((((((.((.(((...(((.((.((.(((((........((((((...(((.((......(((((((......)))))))...)).)))...))))))))))).)))).)))..(((..(((((((((..(.((((((((((..((((.((.((.......((.....))........))))..)))))))))..(((((((...)))))))............)))))))))))))))..))).))).))))))))))).......(((...(((....)))...)))(((.(((((((((.((((((((...((((((((((...(((((((((((((((((..((....)).)))))....(((......))).......((.((..(((((.((((..((((..((((.((((.......(((((......)))))......)))).))))..))))(((....)))...)))).)))))..)).)))))))))..)))))........((((((((((((((((....)))))))))........))))))).))))).))))).))))))))..(((((((......)))))))(((((((((((..(((.(((...))).)))........................))))))).))))(.((((((...(((((....))))).))))).).)))))).)))))))((((((..(((.((((((.(((......))).)).)))).)))..)))))).....((.(((((((((((.(((.........))).))).(((((((.......))))))).....)))))))).))....)))))).)).)).)))))))).))))))).))))))).)))..))))
Thermodynamic Ensemble Prediction
(......)((((.{,(((.(((((({,..{,,{{{{{{{{,.....,...,{|||{{||{({,{{,{..,,.((({...}))){{{.,,,....,}})}.{((({,,,.,}}},(((((.....((((((..........))))))))))){{{{{(({((({{({,{,.(((((..((({(((,{{{(({{{.,||.,,|||}|}}}.}))|,,}}}}}..,({{({{,..{{|,,|.{((.,((((({(......))))))).,})).}}}...||{||{||{{{{{.{{.||....,(..(((((((((..(.((((((((((..((((.((.((.......((.....))........}}}},.))))})))}..(((((((...)))))))..,........,}))))})))))))))..}}{,|||{|.||||||||}{|{{{{{(.,...,(({{{{|{{.,,|,,,.,,,.,,,,,,.,((((((((.,,((((((((((..,{((((((((((((((((..((....}}.)))))....{{{......}}}..,,,,,|{.{{,.{(({{.((((..{(((..((((.((((.......(((((......)))))......)))).))))..)))){{{,...}}},..)))}.}}}}}..}}.,}}}}}))}.,)))}}...,....,(((((((((((((({....}))))))))........))))))}.))))).))))),))))))))})|||||||.}}}}}))))))),,|||||||||,,,||.||}.}})))))))}}}}...............,,,.,)))))))})))}|||{{{{|,..{{{({....)))}),},)))|))),|{(({((((((.((((((.,(((.((((((.(((......))).)).)))),)))..)))))).....((.((((((((.,,{((..........|}|.,,..(((((({.......)))))))},...)))))))).))....))))))}})))).,}}})))),,}})))).})))))).)))}.))))
Forensic Context

No forensic context available.