Basic Information

Symbol
hsa_TCF25_0005400
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa_circ_0003421 hsa_circTCF25_019 hsa-TCF25_0012
Host gene
TCF25
Type of circRNA
Exon-Exon
Location (GRCh37)
16:89958601-89967202 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
16:89892193-89900794 UCSC (hg38)
External Database

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-278.10 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -291.44 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 218.65
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(((..((((((.....(((((((((.....)))))))))(((.............)))((((((....((....))...))))))...(((..((((((((((((((........(((((((((((((.(((......))).)).)))))).......)))))........))))).))))))))))))((((..(((((.((((.((...)).)))).)))))))))((((........((((((((((....)).)).))))))..((((.(((((((.((((((((((((....((((((((((.((..((.((((((((((.((((..((((((....))))))....)))).))))....(((((.((.....)).)))))......(((((((((((..((((........))))...))).....((((....(((((.....)))))....))))..((((...)))).)).)).))))..)))).))))))))))))))))....((((....)))).(((...)))(((((........((.(((((...))))).))......)))))))))))))...))))...))))))).)))).....(((.....)))..))))......))))))..((((((((((((((.((.....((((((...))))))....))...))..)))).)))))))).(((((...))))).)))(((((.((((......)))).)...............))))
Thermodynamic Ensemble Prediction
(((,,(({{{.,....(((((((((.....)))))))))(((.............}}}((((((....((....))...)))))),},||,..(((,((((((,,(({,.....{(((((((((((((.(((......))).)).))))))..,,,.,|||||..,.....|||||,||||}}||||||(({...(((((.(({(.,(...||,||}}.||||}},,,}}}}....})}}||{||{{||,,,,,,}.}),))}))|..((((.(((((((.((((((((((((...{((((((((({{((({((((.((({((((.((((..((((((....))))))...,||||.}}}}||}.,,,,{.((,.{{{||{|,,,,....}}}})).)}}.,|..{{||.{...,,.}}}},.,})}}}}.,{{,{{{{{|{{{,.,,,,}..||.,||{|,((.((((...)))).)),)),},)),}))))})),}))))))))))))}...((((....)))).(({...})){((((........((.(((((...))))).))......))))})))))))}.,,))))...))))))).)))),,...|||,,,||,,,}})}),,.....{{|||{{.((((((((((((((.{,.....((((((...))))))..,,},..,)}..)))).)))))))).,,,,,.}})))))})))||,,....})},.}})))),})}....,..}}..}}))),)
Forensic Context

No forensic context available.