Basic Information

Symbol
hsa_TLK1_0017400
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa-TLK1_0082
Host gene
TLK1
Type of circRNA
Intron-Intron
Location (GRCh37)
2:172081499-172082012 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
2:171224989-171225502 UCSC (hg38)
External Database

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-109.70 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -120.27 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 96.20
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Forensic Context

No forensic context available.