Basic Information

Symbol
hsa_TLK1_0000900
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa-TLK1_0025
Host gene
TLK1
Type of circRNA
Exon-Exon
Location (GRCh37)
2:171853163-171906684 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
2:170996653-171050174 UCSC (hg38)
External Database

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-389.90 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -415.50 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 314.67
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
((......((((((..((((((.......................(((..........))).............((((...((((((((.(((...))))))))))).....)))).........))))))..(((............))).)))))).....))((.((.(((((((((((.((((....))))((((((((.((((...............((((((...(((((((((((((......)))))...(((((....(((...((((.(...(((...(((.(((....)))...))).....))).).))))...))).............))))).......)))))))).))))))...............)))).)))))))).(((...(((((.(((.(((.((((..(((((((((.(((((...((((.(((.(((((.....((((.((((((..(((....((((....((((((((.....)))))..((((...(((.......))).)))).....(((((..(((.((..((((((...((......))......))))))...))))).)))))(((((..............)))))...(((((.(((((.........(((.....((.((((((((((((((((((((((.((((.(((....)))..)))).((((((....))))))....(((((((.......((..(((((...)))))..)).....)))))))......(((((((((...(((((((.((..((((........))))..)).))))((((((..............((((.....))))))))))..................((((((.....))))))...))))))))))))((((((((((((((..........)))))))....)))))))..............)))))))))))......((((((.....))))))..))).)))))))).)).....))).........))))).)))))((((...))))........((((......))))....)))....)))))))..)))))).))))..((((((.....)))))).(((((((.(((.((((....(((((((((.((.(((((.(((((...(((....)))....)))))...))))))).)))).)))))...))))))).))...)))))..))))).....((((((((...................))))))))....((((....)))).))).))))...)))))..)))))))))((((..(((..(((((((((.....)))))))))..)))..)))).....)))).)))...))).)))))...)))..((((((((.((.((((.(((((((((.......(((((((((((.((((((((..............)))))))).((((((((........((..((((....))))..)).(((.((..(((((.....)))))..)).))).))))))))..))))))))))).......))))))..............))))))))).))))))))........)))))))..))))...)).))
Thermodynamic Ensemble Prediction
((,,,...((((((..((((((....................,,.,((,.........},,.............((((.{.((((((((.(((...)))))))))))...,.)))).........))))))..(((............))).)))))).,}}.))((.((.(((((((((((.(((...((((((.,.((((({(,(({....(((((((({.((((((...(((((((((((((......)))))}..(((((..,.(((...((((.(...,{(...(((.{((,,..})),,.))).....}},.,.))))...))).............))))).......,))))))).))))))...((...{((((((..{{{{.,,,,.,......))}),,)))))))...))...(((((((((.{((((,..{((((((({..,{{,.((,(((({,({{,,..||,..,,{,,,.,,,|..(((((.....)))))..((((...(((.......))).))))...,}|||||},|||.{{|.{{{{{(...{{,|.....,......||}}}}...}}|}},})}}}{{{|||,,....,,.,.,.}}}}|...(((((.(((((.........(((.....((.((((((((((((((((((((((.((((.(({....}))..)))).((((({....})))))....(((((((......{{(,.{((((...)))))..)),,...)))))))......(((((((((...{{{((((.((..((((........))))..)).)))|((((((..............{{{{.....)))})))))),.................{{(({{.....}}}},}..,))))))))))))((((((((((((((..........)))))))....)))))))..............))))))))))).....,((((((.....)))))),.))).)))))))).)).....))).........))))).)))))((({...})))........((((......)))).,{{|||,...,}},))),,)))))},}}}}|.,{{({{,....}}))||{(((((,,.{||,||||,...(((((((((.((.(((((.(((((...(((....)))....)))))...))))))).)))).)))))..,))}))}).)}..,)))}}..|,.,|||,..{|||||{{.................,,)))))))}.||||(|,....}}}}.)))}),}},,.}}))),.))))))))).,(((((((...)))))))))))))))).,.))}})))))),},..)))))),,.{{{{{.,,..,.)))}}.},,..((((((((.((.((((.(((((((((.,.....(((((((((((.((((((({..............|))))))).{(({{(({...,,,,.||..((({....))})..,,.(((.((..(((((.....)))))..)).))).})))))))..))))))))))).....}.))))))..............))))))))).))))))))...}}}..)))))))..))))...)).))
Forensic Context

No forensic context available.