Basic Information
Symbol
hsa_TLK1_0001200
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa-TLK1_0087
Host gene
TLK1
Type of circRNA
Intron-Exon-Intron
Location (GRCh37)
2:171853776-171854882
UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
2:170997266-170998372
UCSC (hg38)
External Database
Secondary Structure
Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-273.30 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy:
-296.20 kcal/mol
Frequency:
0.0000
Diversity:
234.64
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(((..((((((((((......(((.(((((.((((..((((.((((.((((((((((((.....))))).((((((((....))))))))..))))))))))).))))..))))))))).))))))))))))...........(((((((...((((((((.(.(((((((((((((.(((((....))))).))))).........(((((.........)))))..)))))))).)..))).)))))...)))))))((((.((((.(((.((((((((.((..(((((.((((((((((..(((.((....((((((((((((((((((((.((((((((.(((((......((((.(((((((.((((((((.(.......................(((((......(((((.((......)))))))..)))))))))))))).)))))))))))......((.(((((((........))))))).)).....(((((............)))))(((((((((..(..(((((((...((((.........))))...))))))).)..)))))))))((((((.(.(((.((.....))..))).).)))).)).)))))))))).))).))..)))))))))(((((..((((((((((.........(((((...(((.......(((...((((((((((.((((.(((.....))).)))).))))...)))))).)))..((((((....))))))...))).))))).......((.(((((((............)))..)))).))..............))))))))))...)))))..((((((.((((.(((.....))).)))))))))))))))))))....))))).))))))))))))))).(((.((.(((((........))))).))))).....)))))).))))))))))))))).(((((((...(((.((.....)).)))...)))))))..(((((((.(........).))))))).........)..)))(((((((((.((((((..........))))))))))))).))
Thermodynamic Ensemble Prediction
(((,,((((((((((......(((.(((({.((((.,((((.((((.((((((((((((.....))))).((((((((....))))))))..})))))))))).)))).,))))))))).)))))))))))}.{{,.......(((((((...{(((((((.{.(((((((((((((.{((((....))))}.))))).........{{{{{.........)))))..)))))))).}..)))}}})))...))))))}((({{((((.(((.((((((((.((,.({(((.((((((((((,.(((.{{,,{.((((((((((((((((((((.(((((((,,(((((..,,,.,.,{,{((((((.((((((((.,.......,,.......,......(((((......(((({,((......)))))))..))))).)))))))).))))))||||,..}}}.{{.(((((((........))))))).)).....(((((..,,.....,,.)))))(((((((({,..,.(((((((...((((.........))))...))))))).)..))))))))|((((((.(.(((.((.....))..))).).)))).)),))))))))))}})).))..)))))))))(((((..((((((((((...{{{...(((,,...|||....,}}{{{...{(((((((((.((((.(((.....))).)))).))))...)))))}.||}..{(((((....))))}|{{{{||.|||}}...,,,...}||||{{{............)))..}))),},...,...,,.....))))))))))...)))))..(((((((((((.(((.....))).)))))))))))))))))))....},))).))))))))))))))},((,{({.(((((........))))).))))).,,,,),)))),})))))))))))))).|||{{((,{,(((.{(.....}}.)))..,)))))))..(((((((.(........).))))))).....},,.,..}))((((((({({((((((..,....,..))))))))))))).))
Forensic Context
No forensic context available.