Basic Information

Symbol
hsa_TLK1_0006500
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa-TLK1_0126
Host gene
TLK1
Type of circRNA
Intron-Intron
Location (GRCh37)
2:171877843-171878659 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
2:171021333-171022149 UCSC (hg38)
External Database

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-293.30 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -308.55 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 164.17
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
....((((.(((..((...((.(((.((...((((..((((.(.((((((.(((((((((.(((((((((..((((((.((((.(.(((.......))).).)))).))))))..)).((((((.(((..((.....(((((((((.((.((((........))))...((((((((......)))))))).................((((((.(((((.((((((((.(((((.(((.....))))))))((.((((((((..((.(((((((.....((((.((((((((((((((((((((((((((((((((.(((((((((((..((....(((((..(.((((.((((((....(((.((((.((((.((((.......((((((((..............((.((((((..(((((.((((.........((.((.(((......))).)).))......((((........))))))))..))))))))))).))...)))))))).........))))))))))))..((((.......)))))))...))).))).)))).)..)))))..)).))))))))))).)))))))))))))))))))))))))))))))).)))).....)))))))...))..)))))))).)))))))))).))))).))))))...............................)).)))))))))......))..)))..))))))))))))))))).))))))))))).).)))).))))...........)).))).)).)).))).)))).
Thermodynamic Ensemble Prediction
,...((((.{{|,|{|,..,,{((.{{{{,.{,{{,{{(((,({(((((({((({{((((.((((((({(,,((((((.((((.(.(((.......))).).)))).)))))|,,||,((((((.(((..((..,,.(((((((((,({.{{{||,,..,,,)))}...((((((((......)))))))).....,{{{,.......((((((.(((((.((((((((,(((((.(((.....)))))))){(.((((((((..((.(((((((.....((((.((((((((((((((((((((((((((((((((.(((((((((((..((....(((((..{.((((.(((({(.{,.{{{.(((,,((({,((((.......((((((((..........,...((.((((((..(((((.((({....,,..{{{.((.{((......))).)).}}|....,((({........)})}}}}}..))))))))))).)),..)))))))).........)))))))))))),,((((.......))))))}...})},))).)))).}..)))))..)).))))))))))).)))))))))))))))))))))))))))))))).))))...,.)))))))...))..)))))))).)))))))))).))))).))))))........,,,....................}}.))))))))).,,,.,))..)}}..)))))}))))))),))).))))))))))).}.)))),))))|,|...|....}},||,.|},},.))),)))).
Forensic Context

No forensic context available.