Basic Information

Symbol
hsa_TLK1_0007500
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa-TLK1_0135
Host gene
TLK1
Type of circRNA
Intron-Intron
Location (GRCh37)
2:171879508-171881302 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
2:171022998-171024792 UCSC (hg38)
External Database

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-357.20 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -399.03 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 421.78
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(.((((..(((((((.........(((........))).........))))))).)))))((.((.....(((.(((((((((((((.....(((((.((..((((((....(((((................)))))((((((........))))))....(((.(((......))).)))......(((.((((((((.((((....))))..)))))))).)))..)))))))))))))..........(((((((((((....((((((.((((((((((((((((.(.(((((.((((((((........)))).)))).))))).))))))))))))....)))))........(((((((((((..(((((((((..((((...(((((...(((.....)))...)))))...(((((((..((((((((..((((......)))).......((((.(((((.......))))).))))....((((((......))))))((((((((.....))))))))......(((((((((((((..........(((((.....)))))..((.(((((((.(((....(((((((...))))))).....(((((..............)))))...((((((.....)))))).....((((..((..((((.....))))..))..))))....)))))))))).)).((((((.........))))))..))))))))....)))))(((.(((((((....(((........)))..((((.(((((((......))))))).).)))..............((((((.(..(((((....((.(((((......)))))))....)))))..).)))..)))(((.((((.......))))..)))))))))).)))..))))))))..)))))))............)))).)))))))))..)))).(((((((......(((((((............................)))))))..)).)))))......((((...(((((............)))))))))((((((((.............))))))))....)))))))....)))))).....)))))))).)))......(((..(((((((((((((.((((((.......)))).)).))))))(((((((.....(((((((((..((((((.(((..(((.....)))...))).))))))......(((((((.((.........(((((.(((((...(((.((((((......((.(.((.(((((..((....((((.((((.....((((.((((((.((.((((((((((..((((..(((..(((((((.((....(((((((((((((.......(((((......))))).......)))))).)))....)))))).)))))))...)))..))))..)))))..((..(((((........)))))..))............................................))))).))))))))))))..))))))))))..)))))))).))....)))))).)))))))).))))))))))))))..(((((((.(((..(((.((((..((((...(((.......))).))))..)).)).)))...))).))....)))))..)).)))))))......)))))))....)))))))..)))))))))...))))).)).))).....)).))
Thermodynamic Ensemble Prediction
(.((((..(((((((.......,{{((,.......})).},......))))))).)))))((.{{.....(((.(((((((((((((.....(((((.((..((((((....,((({................}})}}((((((,......,))))))....(((.(((......))).)))......(((.((((((((.((((....))))..)))))))).)))..))))))))))))).,{{{.....(((((((((((....((((((.{{{{,(((((((((({,(.(((((.((((((((........))))))))).))))).))))))))))))....}}}}}........,,{{({((({(..(((((((((..((({...(((((.,,(({.....))).,.))))).,.{((((((..((((((((..{{{(......||,,..,,,..{(({.{((((.......))))}.})}}...{((((((......))))))|(((((((.....))))))),......{((((((,{{{{{........,,{{{(({{,,,|||}|.{{{{,,((((({(,,....|||||||...))))}),....,||{{(({{,...,})},..})))}...((((((,,,,.||||},.,,{{{{{,..((({{{((.....{{({.{{|....,}},.})}),),))))})).{{{|||,,,,.....}))}}},,}}}))}}},.}})))))(((.(((((((.,{{{,,....,...,,...((((.(((((((......))))))).),}))..............{{{{{{.{..((((({{..((.(((((......))))))).}}.}))))..}.}}}..)))||,.((((.......))))..))}))))))).)))..))))))))..))))))|{{.......}},)))).))))))))),,))))}{{(((((....,.(((((((............................))))))).,))))),}}......||||,..{((({.,,.........))))),,|}{((((({(.............}})))))).},,}}}}}}}....)))))).....))))))))},))..,...,||},(((((((((((((.,,((((.......)))).},.)))))}(((((((..,..(((((((({..((((((.((,..(((.....)))...))).))))))......(((((({,((.........(((((.(((((.,.(({.((((((......((.(.((.(((((..((....{({(,({((,,,..((((,(((((({{({(((({(((((..((((..(((..(((((((..,.,..(((({{(((((((.......(((((......))))).......))))))}.)}....)))).),)))))))...}})..))))..)))))..{({,,{{{||,,...,|}}}},...............,..,},...................,,,.....))))).),)))))))))).,))))))))))..)))))))).))....)))))).)))))))).))))))))))))))..(((((,,.({(,.{{({(((,.,((((...(((.......))).))))..}}.}).)))}},}},.)}....)))))..)),}))))))..,...))))))).,,,)))))))..}},))))))...))))).)).))).....}}.))
Forensic Context

No forensic context available.