Basic Information

Symbol
hsa_TMEM165_0000400
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa-TMEM165_0023
Host gene
TMEM165
Type of circRNA
Intron-Intron
Location (GRCh37)
4:56264534-56265711 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
4:55398367-55399544 UCSC (hg38)
External Database

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-309.80 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -332.77 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 296.32
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(.........)((((((((....(((((.....)))))...(((((((((((((....(((((((((((.......)))))..)))))).....))).))))))..))))((((((.((.((((((((....((((.....((((((....)))))).....))))...(((.((((.((((.((..((((((((((((((((((...)))).((((((.((((((((.(((((((((((.(.((.((((((((((....(((.((((((.(((((.(((...)))....))))).)))))).))).......)))).....(((.(..((((((((..(((((((.((((((((..((..(....)..))..))))).......))))))))))))))))))..).))).(((((((.((..((..(..((((((((.((((.......))))))))))))..)..))..))))))))).((((.((...........)).))))...............)))))).((((.........(.((((((.(((((...........((((((((....(((((.(((((((...((((((.......))))))))))))).)))))....))))))))....((((.........)))))))))..)))))).)...........(((((....)))))....)))))).)..)))))))))))...)))))).)).)))))))))))))).......))))))..)).)))).)))).))).(((((..((.((.........((((((.(((.(.............).)))))))))..((((((.((((.((((((............((((..((((...((((.((.(((...............))).))))))....))))..))))(((((...((..(.(((((((((.............))))))))).).))...))))).....)))))))))).))))))....((((((......))))))..(((((..(((((((............)))))))..))))).)).))..))))).......((((.(((.(((((..(((........)))..))))).))).)))).)))))))).)).))))))......))))))))
Thermodynamic Ensemble Prediction
(({.,{{{{.|(((({{{{....(((((.....))))).,,(((((,{,|||||},..{{{{{,(((((.......))))).,))))}),}{|.}},|||||}|.|}}}|((((((.((.((((((((....((({.,,,.((((((....|}}}}}....,))}},,.{((.((((.((((.((,,((({(((((((((,((((...)))){((((((,(({(((((.(((((((((((.,.({..((.(.((((.{..{((,((((((.(((((.(((...))}....))))).)))))).))),...,,.)))).,.}},,||,..{((((((||{((|(((,,((,(((((..((..{....)..})..))))){{{{...))))},}||||||||,,|.,{{|||.{(((((,.{{..|||,,,,|,||||||.||||}},,...,},))))))})),,},}))}.|||||||,|,{{(((((.((((((((({,..,,.,,..............,,..,..,{,|.|,,,,...,.{(((((.((((({,.........{(((((((....(((((.(((((((...((((((.......))))))))))))).)))))....}))}}))),,,}||{{....,)),.,)).)))))..)))))))))))))))))))},,,.....)))),.}}}))))),....)))))))))))...)))))),)).}))))))))))))),...,,,)})}}},.}).)))}.}}}}.}}}.(((((..({.{(.,....,,,{{{{{{||{{.,,,{,,,,...,,,||}},}})))},.((((((.((({,((((((...,{,.....,((((..((((..,(((((((((({.....}}}.......,,,,,.)))).}..))))..))))|((((...((..{.(((((((((.............))))))))).}.))...))))}..,,,)))))))))).))))))....((((((......))))))..(((((..(((((((,{{,....}}}.)))))))..))))).)).))..))))),,,,,,.((((.(((.{((((..(((........)))..))))).))).)))).)))))))).)).)))))).}}.},)))})}))
Forensic Context

No forensic context available.