Basic Information

Symbol
hsa_RP11-57H12.6_0003600
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa_circ_0005720 hsa_circTMEM56_001 hsa-TMEM56-RWDD3_0001
Host gene
TMEM56
Type of circRNA
Exon-Exon
Location (GRCh37)
1:95609447-95639445 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
1:95143891-95173889 UCSC (hg38)
External Database

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-113.70 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -122.42 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 99.42
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
......(((((.((((((..(((......(((...(((((((((((..(((..((((............)))).......)))...))))..)))))))...))).....))))))))).)))))..(((((((..((((.....))))(((((((((((.....((((((((((.((..((((.....)))).)).))))))....)))).......))).))))))))))))))).....((((((.(((..((((.(((....((((........)))).....(((.((((..(((((((((((((((........((((.((((....)))).))))))))))..))))..............((((((....))))))((((((((((.((((.((..............))))))...)))))))..))).......)))))...)))))))...))).))))...))).)))))).
Thermodynamic Ensemble Prediction
.,,,..(((({.((((((..{((......(((...((((({{{{{{..{{{..{(((............||}}.......,}}...)})),.}})))))...})).....))})))))).)))))..((((((((.,,{{,,.{((((((({(,((((...{((((((((.((.(((,..{(((.....)))))).)),)))))))))})),}.,)))))))).)).)})))))))).....((((((.(((..((((.(((....((((........)))).....(((.((((..(((((,,,,(((((,...,,,,.((((.((((....)))).))))))))})..)))),.............{(((((....))))}|((((((((((.((((.((..............))))))...)))))))..)))}......)))))...)))))))...))).))))...))).)))))).
Forensic Context

No forensic context available.