Basic Information

Symbol
hsa_RP11-57H12.2_0000500
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa-TMEM56_0027
Host gene
TMEM56
Type of circRNA
Intron-Intron
Location (GRCh37)
1:95601232-95601809 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
1:95135676-95136253 UCSC (hg38)
External Database

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-149.80 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -161.76 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 146.29
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Forensic Context

No forensic context available.