Basic Information

Symbol
hsa_RP11-57H12.2_0000400
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa-TMEM56_0028
Host gene
TMEM56
Type of circRNA
Intron-Intron
Location (GRCh37)
1:95600338-95602287 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
1:95134782-95136731 UCSC (hg38)
External Database
circbank

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-507.60 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -543.59 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 373.10
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
((((((((......(((((.((((.(((((((((((((.(((.((.(((.((.(((..((((((.((((((((((.((.(((((......))))).)).........((((((..((((.(((..............)))..))))....)))))).(((((...))))).((((((((((((.((((.....)).)).))))))..))))))..(((.(((((((...(((...(((.....(((.........)))..)))...)))))))))))))..))).)))))))...))))))...........(((((...((((...(((((((((..(((...))).)))))))))..))))...)))))....((((...(((((...........))))).....))))........((((((((((((((((((((...)))))...))))........)))))))))))..)))...))))).)).)))))))))))).).)))))))..)))))..((((......))))((((((((......))))))))(((((........)))))...((((..((((((..((((((.....(((((((((.(((((((((((((........(((((((.....)))))))....((((.((((..(((((((.((....)))).)))))....))))))))((((((((((((((..((((((.((.((((.(((.......((((......)))).((((((((....((((.(((((...........))))).((.((((.......)))).))((((((((.((((((((..........)))))......))).))).)))))...((((((((.(((((((((((((((.((......))((((((.......((((((........))))))((.(((((((..((........))..)))))))))((((..((...))..)))).))))))..((((....(((((((((.((..((.(((((...(((.......)))...)))))...))..)).)))))))))....))))....))))))))..))))))).))))))))..((((((((((((((((...((((((((((.(((((((.((((((..((((((..((((((((((.(.((((((.........))).))))))))).(((((............))))))))))..))))))..))))))......(((((((........))))))).((((....))))..........))))))).)).)).......))))))...))))).))))))))))).........))))....))))))))........))).)).)).)).))((((.....)))).))))..))))...((((.....)))).....))))))))))......................((((((((((.((.((((....(((.......)))..)))).))..))))))))))((((((((......(((....((((((((........)))))))).)))................(((((((......(((..(((.....)))..)))......)))))))...(((.....)))...((((.(((((.......((((((......(((....)))......))))))))))).))))..(((((((((.....))))))))).....))))))))))))))))))))).)))))))))......((((....))))...........))))))..))))))....))))..((((((...))))))))).)))))(...........((((((((((......((((((..((((((((.........))))))))...))))))....))).))))))))
Thermodynamic Ensemble Prediction
((((((((......{((((.((((.(((((((((((((.,{,.(({(((((,{(((.{{.((,({{.,,,...|}}((.(((((......))))).)}.,................,.(((((((((({.,.....{{(,...,,.|||,.((({....}}}}{{{{{{..(((((((,,,,{.,,,({{{{|||,|},|||||,..,.,.,)},||{,{{{{({{...||{...{{{,,,..{{{,..,,....}},.,,})}}})}})}||||||}}.{{,...,)),}},,,},}})}}}}}}}))}}..}})})}.{{,,...(((((((((..(({...))).)))))))))..}},))))))))))}..((((...(((((...........))))).....))))........{((((((((((({{,(((({...}))))..,||||....}}}})))))))))))..,,},.,))))).))})))))))))))).).)))))))..))))},,{{.{{{,(((,{(,((((((((......)))))))).|||,.}}}.,},,))}}...((((..((((((..((((({,,...(((((((((.(((((((((((((........(((((((.....))))))),{..,{||,((((..(((((((.((....))))},))))....))))),}|((((((((((((((..((((((.((,{(((,(((.......((((......)))).((((((((....((((.(((((...........})))}{(({((((.......)))),,,((((((((.(((({(((.,....,...}))))......))).)))}}))))...((((((((.(((((((((((((((.((......))((((((.......((((((........))))))||.(((((((..((........))..)))))))},((((..({...})..)))).))))))..((((....(((((((((.((..((.(((((...(((.......))).,.)))))...))..)).)))))))))....))))....))))))))..))))))).))))))))..(((((((((((,((((...(((((((({(,(((((((.((((((..((((((..((((((((((.,.(((((({......},)}).)))}))))).(((((.,........,.))))))))))..))))))..))))))......{((((((........))))))).((((....))))........,,,)))))).)).)).......))))))...))))}.)))))))))))...,,,,..))))....))))))))........))).)}.,,.)).}){(((.....)))}.))))..)))),..((((.....)))).....})))))))))}.....................((((((((((.((.((((....(((.......)))..)))).))..))))))))))((((((((......(((....,{{(((((,.....}}}}}))))}.)))....,...........,|||||{....,,(((,,((({......,.}))),..,}}}}}}}},...,|{.....})}...((((.(((((.......((((((......(((....)))......))))))))))).))))..(((((((((.....))))))))).....))))))))))))))))))))).)))))))))......((((....))))..........,))))))..))))))....))))..((((({...,))))))))}}))))(...........((((((((((......((((((..((((((((.......,.))))))))...))))))....))))))))))))
Forensic Context

No forensic context available.