Basic Information

Symbol
hsa_RP11-57H12.3_0001100
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa-TMEM56_0044
Host gene
TMEM56
Type of circRNA
Intron-Intron
Location (GRCh37)
1:95661502-95662255 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
1:95195946-95196699 UCSC (hg38)
External Database

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-160.80 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -178.17 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 185.00
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
((..((((....(((((((...))))))).........(((((((..(((((((...(((((((((.........((((....(((((....((((...((....))...))))))))).....)))).((((((((....((((............(((((((((((.((((.((((....((((.(((((..(((((........(((((((......))))))).......))))).))))).))))))))...)))).))))))........((((((...))))))(((((...((((((....))))))))))).)))))))))....)))))))).)))).)))))..))))....)))..)))))))......(((...((...(((((((..((....))..)))))))....))....)))(((((((.......)))))))....)))).))((..........(((....)))........((((((((((((((......)))))..))).....((((((.....))))))((((((..........))))))))))))((((((((((((..((((...........))))...((((((((..(((((((((((((((....)))))).((.((.....((((((.(((((...((((..(((((((...)))))))..)))).)))))..))))))...)))))))))))))))))))))))))...))))))))))
Thermodynamic Ensemble Prediction
((..{{{||,,.{((((({...|)}}}}|{{,....}}}|{({{{|((({{{{..,,}}|||||,,..,,,....{(((....(((((.{{,(({,.,,{(,....)))}))},))))).....}}}}.{{((((((.,,,((((,.........,{((({{((((((.((((.((((....((((.(((((,.(((((.....,..(((((((,...,.))))))).......))))),))))).))))))))...)))).)))))}........|||{{{,,,))||||(((((...((((((....))))))))))),,))))}}))....}}))))))}}})},)}}},........{((((....)))))......{{{...{{...(((((((..((....))..))))))).|,,}}....))){((((((.......)))))))....,,,,.|||,..........,,,.,,,}},........((((((({{(((((......)))))..}},.....((((((.....)))))),,{{,,..........}}}},)))))))(((((((({{{,..((({,{{{....,}}))))...((((((((..(((((((((.,.((,{{..,..)),}|{.((.....{(((((.{((((...{({{..(((((((...)))))))..}}}}.)))))..)))))}...)),.))))))))))))))))),,},...))))))))))
Forensic Context

No forensic context available.