Basic Information

Symbol
hsa_RP11-57H12.3_0000900
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa-TMEM56_0069
Host gene
TMEM56
Type of circRNA
Intron-Intron
Location (GRCh37)
1:95658048-95658672 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
1:95192492-95193116 UCSC (hg38)
External Database
circbank

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-100.40 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -114.70 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 173.98
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(((....((....(((..............)))....))....)))..(((((((.((((((((....((((((....(((.......(((((((((((((((((((......(((.......)))(((((((((....((.(((((.........((.....)).........))))))).....)))).))))).((((((((((((((.(((.((...)).))).))))))).(((.....(((((.(((.((.((((((.....................))))))...))))).)))))...)))...(((((((((............(((.(((((...))))))))...........))))))))).(((...))).........(((((.......))))).))))))))))...))))))))))).....))))))))..)))))).....)))).((.(((((...(((..........)))......))))).))......(((((((..((.(((..........(((.((......)).))).........))).))....))))))).(((((..((((........))))))))).)))))))))))..
Thermodynamic Ensemble Prediction
(((....{{..,.(((..,,.......,..)))....}}..,.)))..(((((((.((((((((....((((((....{{{{,,....{{{{{(((((((((((((((....((((((((((..((..((((((..{{.(((......)))}}..)))))).)).))))}..(((((,......|||}|..,((({,.{.{(((((((((.,,({.{{...,}.))}(({{{{{|(({.....,})).}))))}}..{({((....,}}},...{{({....,,|...,,,,))))....)))))))).)}})}}}},{{{,.......,,,..,{{{(((({...|}}}}}}},..........,,,||||||.{{|...}))...}}))))|{((({{,....)))))}))))).))))...))))))))))).,...}}}}},,,..)))))).....)))).{(.(((((.{{({{..........}}}...,,.))))).,,......(((((({..((,(((..........(({.,{......)),})).........))).))}...))))))).(((({..((((........))))))))).)))))))))))..
Forensic Context

No forensic context available.