Basic Information

Symbol
hsa_RP11-57H12.6_0004900
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa-TMEM56_0046
Host gene
TMEM56
Type of circRNA
Intron-Exon-Intron
Location (GRCh37)
1:95609447-95618158 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
1:95143891-95152602 UCSC (hg38)
External Database

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-112.00 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -123.63 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 145.49
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
((.((((((((((((.(...(((((..............))))).)))))))....))))))))(((...((((((.((((((((((....((((((((((...((((..........(((((((((.(((.(((((((..........(((((((((((.....((((((((((.((..((((.....)))).)).))))))....)))).......))).))))))))..........)))))))...)))))))))))).............(((((((((..((((........)))).....((....))....))))))))).....(.((((.((((.((((....)))).)))))))).).(((((.((............))))))).(((((((......))))))).....))))...)))))..)))))....)))))))..))).))))))(((((((.((((.........))))..((((((................)))))).......))))))))))
Thermodynamic Ensemble Prediction
({,((((((,{(((,,(...(((((..............)))))..))})))....))))))))(((...((((((.((((((((((....((((((((,{{{{(,,,.,{.......(((((((((.(((.(((((((.....,|...(((((((((({....{(({((((({(,((.{((((.....})))|}}|))}}}|..|||))).......})),,}))))))....}}....)))))))...)))})))))))}.............((((((({(,.{(((..,,,,..}}}}....,||....))....))))))))).....,|{{{{.((((.((({....}))).)))))))},}.|||||}}|,,,,.......{|{|||,,.,||||||....}.)))}))},,..,}))}.}}))))),.}))))....)))))))..))).)))))){((((((.{(((.........)))}..((((((....,.....,,....)))))).......))))))})))
Forensic Context

No forensic context available.