Basic Information

Symbol
hsa_TPCN1_0003200
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa_circ_0028478 hsa_circTPCN1_009
Host gene
TPCN1
Type of circRNA
Exon-Exon
Location (GRCh37)
12:113705648-113716640 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
12:113267843-113278835 UCSC (hg38)
External Database

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-275.40 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -290.98 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 138.21
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Forensic Context

No forensic context available.