Basic Information

Symbol
hsa_TPCN1_0006000
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa_circ_0028493 hsa_circTPCN1_025
Host gene
TPCN1
Type of circRNA
Exon-Exon
Location (GRCh37)
12:113711374-113718000 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
12:113273569-113280195 UCSC (hg38)
External Database

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-136.30 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -145.32 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 130.13
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
((....))((((((.(((((..........((((.....))))............(((((.((((((..(((....)))..)))...))).)))))(((.((((((((((.(((((...)))))......(((.((((...((....)))))))))..(((....)))..((((...))))....((((.((.....)).))))...))))))))))))).(((((.............)))))...((((((((..((.(((((.((((.....(((((((((((.(((((((((.((((.((((..((((..(((..(((............))).))))))).)))).............((.((((((....)))))).)).(((((..((..(((..(((......))).)))..))..))))).)))).)))))))))..........))))))..)))))))))))))).))))))))))..)))))))))))
Thermodynamic Ensemble Prediction
({....})((((((.(((((..,,,.....,,((,.,{.,.))},}.}||,,..,{((({.({((((..(((....)))..))),..}}}.})))}(((.((((((((((.(((((...)))))..,,,.(((.{(({,..,,....}))))})))..{((....))}..((((...))))....((((.((.....)).))))...))))))))))))).(((((,,.....,,..,.)))))...((((((((..({.(((({.{{{||....|{|||||{|||.|||{{(({(.(({,.((((..((((.,(((..(((............))).))))))).}))).............{,.((((((....)))))).}},((((({((,..,{{..(((......))}.}}|,.}}.,}})}}})))}.))})))))),..,,,,,,,||}}},..}))))))})))))}.}}}))))))),,))}}}))))))
Forensic Context

No forensic context available.