Basic Information

Symbol
hsa_TPCN1_0006600
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa_circ_0028495 hsa_circTPCN1_027
Host gene
TPCN1
Type of circRNA
Exon-Exon
Location (GRCh37)
12:113715994-113728048 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
12:113278189-113290243 UCSC (hg38)
External Database

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-233.90 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -248.02 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 191.65
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
((((..((................((((((....)))))).(.(((((((((..........((((((.(((..(((..........)))..))).))).)))..(((((((((.........)))).))))).....))))))))).)......((((((((((.((((((((....((((....(((((.(((((((.(((((........))))).((((......((((.((((((.(((((((((((...........))))..)))).)))(((((((.((((((..((.(((.((((((.(((....(((((.....(((((..(((..(((((((((..((......))))))).))))....))).)))))....(((((.((.((.(...((((((........)))))).).)).)).)))))..)))))...))).))))))..))).))..))))))))).)))).))))))))))......))))(((((.((((((..((((((.(((..(((.....))).)))...................))))))..))))).).))))))))))))))))).....)))).)))))))).)).))))))))((((..(.((((.......)))))..)))).)).))))(((.((.......((.(((((.(......(((((....)))))........).))))).))..)))))
Thermodynamic Ensemble Prediction
,,,...({................(((((({,..||},||,({(((((((((..........({((((.(((.,(((..,,....,.)))..))).)))),))..(((((((((.,,....,,)))).))))).....))))))))).,.,,,},((((((((((.((((((((....((((....(((((.(((((((.{,{{{.,,,,.,.}||||,((({......(((,{((((((.(((((((((({...........})))..}))).)))(((((((.((((((..((.(((.((((((.(((....(((((.....(((,,,{(((.{(({({{{{{.,,..,,}}}).))))).)))}.|,.}}}.))))}.,,.(((((.(({({.,.,,((((((.....,,.)}}}}}.),)).)).)))))..)))))...))).))))))..))).))..))))))))).)))).))))))))))......))))(((((.((((((..((((((.(((..(((.....))).)))...................))))))..))))).).)))))}))))))))))).....)))).)))))))).)).)))))))){{({,,{.{(((.......)))}}..}}}|{{{{|||,,.....,.))}))))}(((((.{..,...{{{{{.,,,|}}}}.,}},...,.)))))..}}))))))
Forensic Context

No forensic context available.