Basic Information

Symbol
hsa_chr12_0099800
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa-TPCN1_0034
Host gene
TPCN1
Type of circRNA
Intergenic-Intergenic
Location (GRCh37)
12:113667586-113668418 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
12:113229781-113230613 UCSC (hg38)
External Database

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-245.40 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -260.70 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 193.13
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
((((.............((.((((....)))).))....(((...((..(((((((((...((....))....)))))).))).))...))).......(((((((((((.........(((((((((((..(((........(((((((.((((............))))..(((((((......)))))))(((((....)))))((((((((.((..((((((..(((((((...(((((..(((((((.(((.....)))..)))))))))))).)))))))....))))))..)))))))))).....................((((......)))).)))))))....)))..)))))))))))..))))).....))))))....((((.(((((.........(((((........((((............))))(((.((...(((.((((((.......((((((((.((((.(((.(((......))).))).))).).))))))))..)))))).)))...)))))...........))))).......(.((((((((((...(((((.....)))))...))))).))))).))))))))))))))((.(((....((((((...))))))((.(((((.(((....(((((((((.(((((.((..((((...(((..(....)..)))..))))..)).....))))).))..((((.(((.......))).))))..)))))))......(((((((((((((..((((...)))).)))).)))))))))....))))))))..)).))).))
Thermodynamic Ensemble Prediction
((((((..{......}..})))}}.(((((........))))}...,|.(((((((((,,.((....)).,,.)))))).))).||{,,{,........(((((((((((.........(((((((((((..(((........(((((((.,{{,............,,,,..(((((((......)))))))(((((....)))))(((((((((((.,((((((..(((((((...(((((..(((((((.(((.....)))..)))))))))))).)))))))....)))))),.)))))))))).....................((((......)))).)))))))..,.)))..)))))))))))..))))).....)))))).....,{{.{{{{{.....,,{,,{{({..{{,...((((............)))},||,.,..,{{{.((((((..{,,..{{{{((({.,{{{.|||,||,......|},,|}}.})).).}}})))))..)))))).))),.{||{.},{{{,..|,.,,||||,.....,(.((((((((((...{{(((.....)))))...))))),,)))).).,.,{|..,,,.)|...,,....(((((,...}))|}}({,((((((((({...{,((,((((.{{{((.{(,,(((....{....,.,..),)))},}))))}))).,...,))))})}}}((((.((({....,.))).))))..))))))},....|(((((((((((((..((((...)))).)))).))))))))}.,..}))))),,)})),})),},
Forensic Context

No forensic context available.