Basic Information

Symbol
hsa_TPCN1_0000800
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa-TPCN1_0020
Host gene
TPCN1
Type of circRNA
Intron-Intron
Location (GRCh37)
12:113669460-113669972 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
12:113231655-113232167 UCSC (hg38)
External Database

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-177.70 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -185.80 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 147.25
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
....(((((((((((((((((...(((......)))......(((((...))))))))))))))).)))))))(((.(((((((..(((((.((.((((......((.(((.....((((.((....)).))))......))).)))))))))))))..))))))).)))((((((((((.((((((((((((......))))(((.((((((((((..((.((((.(.(((........)))))))).)).))))))(.(((((......))))).)...((((((...(((..(((.((((..((.((((.((((((..(((...)))..))).....))).)))))))))))))..)))..))))))((((...((((((((.((((.......(((((.((((.....(((((.......)))))..)).)).))))))))).))))))))))))...((((((((((...)))).)))))))))).))))))))))).))))))))))
Thermodynamic Ensemble Prediction
{...(((((((((((((((((,..,((......))}......{((((...))))))))))))))).))))))),((.(((((((..(((((.{,,((((..,...((.(((...,,(({(.{{.,,,)}.}}))......}}),)}}})})})))))..))))))).)))((((((((((.{(((((((((({......})}{((({(,,,,,({{({{(({((((.({(((.(((....))).,{{{{{{.,....,))))))))))}.(((((.(((((((((...,,.....}|.})))))))).)))))..,{{,..{|,....,|{{{||...)))))},,))))),.)))))))},..,)))))|{{,...((((((((.((((.....,,(({{{.{,||,,...((((({{,....,,))),,)).}},)))}))))).))))))))}}|||,.((((((((((...)))).)))))),)},}))))))))))).))))))))))
Forensic Context

No forensic context available.