Basic Information

Symbol
hsa_TPCN1_0002200
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa-TPCN1_0042
Host gene
TPCN1
Type of circRNA
Intron-Intron
Location (GRCh37)
12:113702253-113702866 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
12:113264448-113265061 UCSC (hg38)
External Database

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-363.90 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -371.59 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 55.28
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
((((.....))))(((((.(((((((((((((.((.((((((.((((((((((((((..(.((((((((((((((((((((((((((..((((((((((((..(((((((..((((((((((..((((((((((((((.(.(((((((((((((((((((((.((((((((((((((((((((.(((.(((((((.(((((((((((((.............(((((((((.(((((((.(((.(((((.(((((((....))))............................((((((((..........(((((........))))).....))))))))....((......))....((((((((.((.....)).))))))))))).))))).))).))))))).)))))))))))))))))))))).))))))).))).)))))))))))))))))))).))))))))))))))))))))).).))))))))))))))..))))))))))..)))))))..))))))))))))..)))))))))))))))))))))))))).)..)))))))))))))).)))))).)).))))))))))))).)))))
Thermodynamic Ensemble Prediction
((((.....))))(((((.(((((((((((((.((.((((((.((((((((((((((..(.((((((((((((((((((((((((((..((((((((((({..(((((((..((((((((((..((((((((((((((.(.(((((((((((((((((((((.((((((((((((((((((((.(((.(((((((.((((((((((((({..,,,,,.....||||(((((.{((((((,{({.{((((.((((((,....}}}|......,{{......}}},.....,}|.((((((((.{..,{{{..(((((........)))))))}}.)))))))).....|......||....((((((((.((.....)).))))))))))).))))).))).))))))).))))))}})))))))))))))).))))))).))).)))))))))))))))))))).))))))))))))))))))))).).))))))))))))))..))))))))))..)))))))..})))))))))))..)))))))))))))))))))))))))).)..)))))))))))))).)))))).)).))))))))))))).)))))
Forensic Context

No forensic context available.