Basic Information

Symbol
hsa_TPCN1_0004800
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa-TPCN1_0060
Host gene
TPCN1
Type of circRNA
Intron-Exon-Intron
Location (GRCh37)
12:113709418-113711473 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
12:113271613-113273668 UCSC (hg38)
External Database

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-422.30 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -444.27 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 281.31
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Forensic Context

No forensic context available.