Basic Information

Symbol
hsa_chr12_0100400
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa-TPCN1_0015
Host gene
TPCN1
Type of circRNA
Intergenic-Intergenic
Location (GRCh37)
12:113717454-113720294 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
12:113279649-113282489 UCSC (hg38)
External Database
circbank

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-939.30 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -993.07 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 565.94
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
((.((((((((..(((((((((..........(((...((((....(((..((((...(((((.........(((.((......)))))..(((((((((((....)))).((.((((((((...((((((....))))))((((.((((.(((.((.(..(((....)))..).))...))).))))))))...(((((((.......))))))).....................))))))))))..(((((((.((((........(((((((.((..((((((((((..((..(((..(((((((....((((..(((((((.((.........)))))))))))))..))))))).)))..))....)))))))))).......................(((((((((((((((((((((((((..((((((....)))))).((((.((..(....((((((((.((((...((((.(.(((.((((((.((.........))))))))))).).))))))))....((((((((((...)))))))))).................(((((((...(((((.((((((((..((((.((((((..((((..(.(((....)))).)))).((((.......)))).(((((.(.((((((((...((((.((((..((.(((.((....))))))).)))).))))..))).)))))).)))))..((((((((((.......(((((......))))).....................)))))).)))))))))))))).....((((((((((((((....))))(((((.(..(((((((((((((((....)).))))).))))...)))).....).)))))..(((((.((......((((((((((((...((....(((((.......((.((((((((.((((......(((((((......)))))))........)))).)))))))).))...)))))....))......))))))))))...))......)))))))...))))))))))..)))))))).)))))...)))))))((((((......((((((....))))))((((((((((.......))))))))))((((((.((((((((((((((....((((((....)))))).....))))(((((((.((((((..(((((((...........)))))).)..)).))))....)))))))...................(((((((...((((.....))))......))))))).(((((((((((((..(....)..))))))...)))))))..(((.....))).))))))......))))...))))))..((((((.......))))))...........(((((((((((((((((.(((((((((((((...))))))))))))).)))))))))))))))))...((((.(.(((((((..(((.((((.(((((.((((((........))))))...................))))).)).)))))....))))))).)..)))).)))))).))))))))...).))))))...((((..(((((((((........(((((......))))).......((((.((((.(((((...))).)).........(((.(((.(((((..((((......(((((.((...((.((......)).))...........(((.(((((((.(((((.((((((.(((...(((.......)))(((..((((((((..............))))))))..))).))).)))))).))))).))))))).)))...))))))).....)))).))))).))))))...))))))))..((((.....((((................)))).(((((((((((.....)))))))))))....))))...................)))))))))))))((((......))).)..((((((.(((........))).)))))).((((((((((((((((....(((....(((((((.((((....(((.(((((..(((((((((....((((((..((..........))..))))))...)))).........(((((...(((((((((((.(((...((((.(((.(((.(((........)))...)))...)))))))...)))))))))))..((.(((((((..........)))))))))......(((((.......))))).........))).))))).......(((........)))......)))))))))).))))))))))))))))).....)))))))).))))))))))))))))..))))).)))))))))(((((((...(((...(((((((((((((((.....))))))...(((((((((((((((......((((.((..(((((..((((...((((((((..((.(((.........)))))..))))))))))))..)))))....)).)))).....))))))).....))))))))))))).))))....)))))))))).......)))..)).))))))).....)))).))))))).......................)))))))....)))))...))))...)))..........((((........)))).))))..)))..........)))))))))..)))))))).))(((....((..((((((...))))))..)))))
Thermodynamic Ensemble Prediction
((.((((((((..(((((((((..........,{,...((((....(((..,(((,..,{{{,.........{((.{{......}}))}..(((((((((((....)))){{(.{,{|||({...((((({....}))))){(((.|{{{.{{{,{{{{..{({.,,,),|,||||,|,.|||,|||||||}...{{((({....}}},},,,,,,...................}}))))),)))|,,(((((((.((((.(((((,....}))))){{{((((((((((..{{..({(,.(((((((....((((..(((((((.((.{......,)))))))))))))..))))))).})).,})....)))))))))}.......................}}}((((((((((((((((((((((..((((({....,))))),((((.((,.,,...((((((((.((((...((((.{.(({{((((((.((.........))))))))))).}.))))))))....((((((((((...)))))))))).................(((((((...(((((.((((((({..((((.(((({(,.((((..(.(((....)))).)))).((((.......)))).(((((.{.((((((((...((((.((((..((.(((.((....))))))).)))).))))..)))}}))))}.)))))..((((((((((.,.....(((((......)))))........,,,.....,}}.})))))).))))))))))))))...{{((((((((((((((....))))(((((.(,.((((((((((((({(....}).})))).))))...))))..,..).)))))..(((({,((......,,((((((((((...,...,,{{{{{.......((.((((((((.((((,,.,,.(((((((......))))))).,,...,.)))).)))))))).))...})})}....))......))))))))))....,......)))))))...)))))))))},))))))))).)))))...)))))))((((((,{{{,.{(((((....)))))}((((((((((.......))))))))))((((((,{(((((((((((((....((((({....}))))),}},,))))|{|||{{,|||||(,{((|,((((({,..{{{{{,,.})),)..,},}})}.,}})))}))}}..................{(((((({{,((((.....))))||,,,,|))))||.(((((((((((((..{....}..))))))...))))))).,||,|.}}}))),)))})).....,))))},.)))))),.{{{{{{..,,,,,}))))),}.........(((((((((((((((((.(((((((((((((...))))))))))))).)))))))))))))))))...((((.{.(((((((..{((,(,,{.{{{((.((((((........)))))).,.........,,,.,,,.}}})),}),),))),...))))))).}..)))).)))))).))))))))...).)))))).,.{(((..(((((((((........{((((......))))}...{,,.{{({(((({.,{(({,.,|||{|,..{{...,,((|{{((,{((((..((((....,,||{{|,||.}}}.,,,,..,,,,..,}}...,,,,,,,|((.(((((((.(((((.((((((.,{{...(((.......))){((..((((((((.,,.........},))))))))..))}.}},.)))))).))))).))))))).))}...|||,,,)}},}}}}}|.}}})).}))}}|...}}}}}))}..((((.....((({................}))).(((((((((((.....)))))))))))....))))................,..))))))))))))}{({{......}}},}}}|{((((,{{{.....,,.},}.)))))}.((((((((((((((((....{{{,{,.(((((((.((((....(((.(((((..{((((((({.(((({{{(((,,(((((({{...((.((((.....)))))),}}))}}||,........,|{((((((.(((.,{((((.{{(,(((.(((........)))...)))...)))))))...)))))))))))})))}|||||||}},.......,},,,,,,|,,,,|.{{{{{..||||.}}|||.,.....,.}}}.,,|},,,....,{|{{||....,|,,..,,,}}})))))))),))))))))))))))})),....)))))))).))))))))))))))))..))))).))))))))),{{{{{(.,,({{...{|||||{((((((((.....)))))))}.(((((((((((((((......((((.{({{(((((..((((...((((((((..{{.{{(,,,,,....)))})},))))))))))))..)))))...})).)))).....)))))))),....})))))).,})).))))....))))))))}|.,,....({{...,}}}..,},.....)))).)))))))...,,......,...,,,,,...)))))))....}}}}}...))))...)))..........((((........)))),))))..,,}..........)))))))))..)))))))).))(({....((..((((((...))))))..)))))
Forensic Context

No forensic context available.