ForensicRNA
Home
Atlas
Index
Marker Scope
|
About
Feedback
ForensicAgent
Home
Index
hsa_chr12_0100500
Basic Information
Symbol
hsa_chr12_0100500
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa-TPCN1_0038
Host gene
TPCN1
Type of circRNA
Intergenic-Intergenic
Location (GRCh37)
12:113721314-113721569
UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
12:113283509-113283764
UCSC (hg38)
External Database
circbank
Secondary Structure
Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-113.60
kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy:
-117.45
kcal/mol
Frequency:
0.0019
Diversity:
30.38
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
COPY
(((((..(.((((((((((((((..(.(((.((((((((((.((((((((((((.((...((((((((.(((...(((((((((((((.(((((((((.....))))))).....)).))))))))))))).))).)))))))).)).)))))))))))).)))))))))).))).)....)))))))))))))).)..)))))(((.((....))...........(((((((........)))))))....)))
Thermodynamic Ensemble Prediction
COPY
(((((..(.((((((((((((((..{.(((.((((((((((.((((((((((((..,{..((((((((.(((.{,(((((((((((((.{{(((((((.....))))))).....)).))))))))))))).))).)))))))).)).)))))))))))).)))))))))).))).}....)))))))))))))).)..)))))(((,((....))...........(((((((........)))))))....)))
Forensic Context
No forensic context available.