Basic Information

Symbol
hsa_chr12_0100500
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa-TPCN1_0038
Host gene
TPCN1
Type of circRNA
Intergenic-Intergenic
Location (GRCh37)
12:113721314-113721569 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
12:113283509-113283764 UCSC (hg38)
External Database

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-113.60 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -117.45 kcal/mol
Frequency: 0.0019
Diversity: 30.38
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(((((..(.((((((((((((((..(.(((.((((((((((.((((((((((((.((...((((((((.(((...(((((((((((((.(((((((((.....))))))).....)).))))))))))))).))).)))))))).)).)))))))))))).)))))))))).))).)....)))))))))))))).)..)))))(((.((....))...........(((((((........)))))))....)))
Thermodynamic Ensemble Prediction
(((((..(.((((((((((((((..{.(((.((((((((((.((((((((((((..,{..((((((((.(((.{,(((((((((((((.{{(((((((.....))))))).....)).))))))))))))).))).)))))))).)).)))))))))))).)))))))))).))).}....)))))))))))))).)..)))))(((,((....))...........(((((((........)))))))....)))
Forensic Context

No forensic context available.