Basic Information

Symbol
hsa_TTBK2_0006200
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa_circ_0034868 hsa_circTTBK2_008 hsa-TTBK2_0047
Host gene
TTBK2
Type of circRNA
Exon-Exon
Location (GRCh37)
15:43086842-43170882 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
15:42794644-42878684 UCSC (hg38)
External Database

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-291.90 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -312.05 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 313.72
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
((....(((...(((....)))...)))...))((.((((((........((....(((((...((((((((.((((((((((.((((((((((.((.(((.(((.(((((((((..(((.(((....(((.((((.........(((((.((((((((((((((..((((((((((..((((((.........))))))....(((((..((((........))))..)))))..((((((((.((((......)))).)...)))))))........(((.((......)).)))))))))))))((((((((((((((((.((.(((((((.(((.(((((........))))).)))..))))).))))..))))).))))))))))).))))))).).)))))).)))))..)))).))).(((.(((((((..........)))))))...))).))).)))..))))))))).)))))).)).))).(((((.((((((((((((((((.......))))..((((((((((..(((((((.((((((....((..(((((.(((...((((((.......)))))).))))).))))))))))))))))))........((((((((.((((((((......((..(.((..((........))..)).)..)))))))))).))...)))))).)))))))))))))))))))))))))))...)))))))(((..(......)..)))....(((((......)))))...(((((((((((((.....(((...((((((((...(((......))).))))))))...)))....)))))))))))))(((..............(((.....((((((((((((.((((..(((((........))))).....)))))))...........(((........)))))))).))))......)))..............)))...))))).)).))))))).)))))))))....))......))))))...))
Thermodynamic Ensemble Prediction
({....,((,..(({,,{{|||{{.|,|,..|}{({({(((({{{{{{.{(,..{{(,(({...|||,|||{,||{{{{{{||||}}|}}|{||,|||,,,|.|..}}|||||(((((((,(...(((((...(((((..{,.,,,{(((((((((..(((.(((.(((,,....{.((((((((,,...{{{....)))....(((((..((((........))))..)))))..((((((((.((((......)))).}.,.)))))))...,,.((((({((......)).,.})))))).})}{{((((((((((((((.((.{{(((((.(({.(((({.,.....,))))).)))..))))).}}))..))))).))))))))))),)))))))},.))).)))..))).))))})}))}|((.,{{{{((,......,,.}}|}}}},,.}|}.,||.|}}.,}})))}})),}},)),,)))}},...)))))...}))))))}.((((((((((((((.......))))),.(((((((.((((((....((..(((((.(((...((((((.......)))))).))))).))))))))))))))))))..{((((.((((.(((({.,...,{,,,,,{(({{(,{{{{,,{{{,{((((,.{{(,,....}}}.,.,,|},..},)))}}|||||{|.,,,,,)))}})}.}})))))))}}))))))))).))))}{{{{{..(((.(((((((..((((.,|||...{((((((((((((..,..(((...((((((((...(((......))).))))))))...))).,..))))))))))))}{{|.,,........,,.}}}}.))))..)))))))...))).}}}}}..((({.((.((((,...,}))).)).}))).}))))))))....,...{|||||||.||||...,|.|||}},,}...}},,,,}}},}.))))).)),}}))|||{||||||},,.|,.,}......)}))))},}))
Forensic Context

No forensic context available.