Basic Information

Symbol
hsa_TTBK2_0007000
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa_circ_0103527 hsa_circTTBK2_033 hsa-TTBK2_0050
Host gene
TTBK2
Type of circRNA
Intron-Exon-Intron
Location (GRCh37)
15:43101303-43120230 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
15:42809105-42828032 UCSC (hg38)
External Database

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-481.80 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -518.44 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 454.77
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Forensic Context

No forensic context available.