Basic Information
Symbol
hsa_TTBK2_0007900
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa_circ_0003334
hsa_circTTBK2_027
hsa-TTBK2_0012
Host gene
TTBK2
Type of circRNA
Exon-Exon
Location (GRCh37)
15:43102812-43122276
UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
15:42810614-42830078
UCSC (hg38)
Secondary Structure
Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-142.90 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy:
-153.03 kcal/mol
Frequency:
0.0000
Diversity:
108.93
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
((.(((...((((((((((((((((.(((((.(......((.((...........)).)).....).)))))))).)).))))))(((.((((..((.(((.((((........)))).))).))...)))).)))(((((.((((((((((((((((.......))))..((((((((((..(((((((.((((((....((..(((((.(((...((((((.......)))))).))))).))))))))))))))))))........((((((((.((((((((......((..(.((..((........))..)).)..)))))))))).))...)))))).))))))))))))))))))))))))))).))))))))))((((((...............(((((......)))))...(((((((((((((.....(((...((((((((...(((......))).))))))))...)))....)))))))))))))(((.((........)).)))..)).))))
Thermodynamic Ensemble Prediction
((,{((,,,(({(({((.,...,,,.{{.((((,(,.((({..............},....,})}}.)))))),||||{}||,,.,{{,||||,,{({,,|.,||},.}}}}}.))))}}},,,..,,}|}|.|||(((((.(((((((((((({(((.......)))}..((((((((((..(((((((.((((((....((..(((((.(((...((((((.......)))))).))))).))))))))))))))))))...,.,,.(((((({(.((((((((,.,...{{..(.({..{{........)}..)).)..)})))))))),}}...)))))).}))))))))))))))))))))))))))}))},,)})))((((((...............(((((......)))))...,((((((((((((..,..(((...((((((((...(((......))).))))))))...))).,..))))))))))))|(((.{{........}}.))),.)).))))
Forensic Context
No forensic context available.