Basic Information

Symbol
hsa_TTBK2_0010000
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa_circ_0103530 hsa_circTTBK2_012 hsa-TTBK2_0027
Host gene
TTBK2
Type of circRNA
Exon-Exon
Location (GRCh37)
15:43109230-43164956 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
15:42817032-42872758 UCSC (hg38)
External Database

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-142.90 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -153.19 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 124.87
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
..(((....(((((.((((((((((((((..((((((((((..((((((.........))))))....(((((..((((........))))..)))))..((((((((.((((......)))).)...)))))))........(((.((......)).)))))))))))))((((((((((((((((.((.(((((((.(((.(((((........))))).)))..))))).))))..))))).))))))))))).))))))).).)))))).)))))....)))(((((((.(((((((..........)))))))...)))........((((.((((..(((((((((........((.((((((((.(((((((.(((.(((((((.......)))))))........(((.......))).(((((.(((...((((((.......)))))).))))).)))...))).)))))))))))..)))).))....))))..)))))..))))..))))...)))).....
Thermodynamic Ensemble Prediction
{.(((,...(((((.((((({{(((((((.{(((({{{{({..((((((.........))))))....(((((..((((........))))..)))))..((((((((.((((......)))).},,.)))))))......{,(((.((......)).}}}))))))}))){(((((((((((((((.((.{{(((((.(((.(((((.,.....,})))).)))..))))).}}))..))))).))))))))))),))))))).).)))))).})))).,,.}))}}|}{(({{((((((..........))))))},,.,,,.,}},.,,((((.((((..((((({({({,......((.((((({{(.(({{{{{.{,||(((((((.......))))))},{{{{{{.((({{{....||,.(((((.(((...((((((.......)))))).))))).)))}}})))}))))))))))}.,)))).))...}}))}..)))))..))))..))))...,,},.}}),
Forensic Context

No forensic context available.