Basic Information

Symbol
hsa_TTBK2_0001000
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa-TTBK2_0042
Host gene
TTBK2
Type of circRNA
Exon-Exon
Location (GRCh37)
15:43037968-43045445 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
15:42745770-42753247 UCSC (hg38)
External Database

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-495.50 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -528.46 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 449.15
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
.......(((((.((....(((((.......)))))......))))))).((((((..(.(((..((((((...(((((....)))))......(((..((..((((((...((((((((((..(((.........((((((.(((.(((...((((.((.(((((((.(.((((((((.....(((((.(((((.....((....((.(.(((((((((..(((((....)))))..((((..........)))).((.((((((((..........(((((.........((((((((((((((((.((((....(((..((((((...((((.((.....((.((.(((((((.(.((((.(((..((((.(((((((.((.(.(((((.(((.((...(((.((((((......((((((.(((((((...((((...((.....))...))))))))))).)))))).((((.......))))((((((((((((((.(.....((((............(((((..(((((.((((((...)))))))))))...)))))...........)))))))))))..))))))))(((((.........(((....)))............))))).....(((((((.....((((....)))).....))))))))))))).)))(((.(((((((((.((....))))))))))))))............(((((((....)))))))........(((.....)))))))).)))))).))..((((((((.(((((.(((((((.(((((..(((((.((((........))))))))).))))).))).)))).))).(((((.........)))))(((((.....))))).(((..((.....)).)))...((.((((((...(((...))))))))).))............)).))))))))((((((((((((((.(((((((((.........)))))).........((((((((....((........((((((((.(((....))).))))))))))...)))))))).....))).)))).))))).)))))...))))))).))))...))).))))...).))))))).))))...((((((.((((....((.(((((.(((..((((.((((..........)))).))))..)))(((((((.((......)))))))))..))))).))))))))))))....(((((((...(.(((......(((..(((((((....)))))..))..)))....))).).)))))))(((............))).))))))...)))))).(((((....))))).)))...)))).))).)))))))......................))))))........)))))))))))).).))......((.((........)).))((.((((((((.(((........))))))))))))).....))))))))).)))..))..))))).)))))(((((...........)))))..((.....))..)))))))).).)))))))(((.....((((....((((.......))))......))))..)))......)).))))...))).))).))))))..........)))....)).))))))))....))..........))))...))..)))))))))))).)..))))))
Thermodynamic Ensemble Prediction
.......,{({{.,{.{{{((((({{..,,.|||||{..,,{|,}}}}},,{||{|}}|}|{{..|,{||||.|||||{.,,,,,,,|,,((,.(((,,{(.,(((({(...{(((((((((..(((.........((((((,(((.(((...((((.{,.,((((((.(.((((((((.....(((((.(((((.....((....((.(.(((((((((..{((((....})))}..((((..........)))).,{.{(((((((..........(((((.........((((((((((((((((.((((....,((,.((((((...((({,({.....((.((.(((((((.(.((((.(((..(((({({{((({.{,.(.(((((.(({,{{..,{(({((((((......,|||||}|||(((,...((((...{{.....}|,,,}}}}}}))))}.}|||||{(,((.,,...{|||}{{,,,{{,||||{{}|.}}.}||||},..........(((((..(((((.((((({...}})))))))))...})))),,|,,.,,...||||||,,||,..}),,))))},....({{....}||,,,,,|||..............{|,...||(((((((....,((((....))))}....))))))}|||||}.}}}(((.(((((((((.((....))))))))))))))....,.....,.(((((((....))))))).|||||||||{.....}))))))),)))})}.,,..((((((((.,((((.(((((((.(((((..(((((.((((........))))))))).))))).))).)))).)))}.{(({....,,,,.)))},{((((.....))))}.|||.,||,...{||,|||,|,{{.(({,((,.,{||,..)}})))))}|}}.....,,,....,..)))})))){(((((((((((((.(((((((((.......,.)))))),,.......((((((((,,{.((,......,{|||{|||.{({....))).)))))}))}}...}})))))).,,,.))).)))).))))).))))).,.})))))))))))...))).))))...).))))))).))))...(((((,,((((....((.(((((.{((..((((.((((..........)))).))))..))}(((((((.((......)))))))))..))))).))))))))))))....(((((((...(.(((...{{,(((..{{(((((....)))))..}}..))).}},))).}.))))))),,,..,,,.......,)),))))))...)))))).(((((....))))).,)),..)))).)))}}))))))....................,,)))))),.......)))))))))))).}..},.....((.((........)).))((.((((((({{(((........))))))))))))).....))))))))).)))..)),.))))).)))))(((((...........)))))..((.....))..)))))))).).))))))|((((....)))),.,.((((.......)))}...||{{{||,..}}..,.}|)}.))))},,}))})}}.)))))).........,})}....)),}))))))},.,.|},,,...,|,.,}}}...))..)}})))))}}})})},}}}}}}
Forensic Context

No forensic context available.