Basic Information

Symbol
hsa_TTBK2_0001600
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa-TTBK2_0056
Host gene
TTBK2
Type of circRNA
Exon-Exon
Location (GRCh37)
15:43044172-43075833 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
15:42751974-42783635 UCSC (hg38)
External Database

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-684.10 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -727.63 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 529.98
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
..(((((...((((.(((((((.(((((((..((((((..............))))))))))))).......((...))))))).))...((((((((...((((((...)))))).(((((..(((...((((((((((......)))))..))))))))..))))).........))))))))(((((..((((......))))...)))))..(((((((.((....)).))..))))).))))..))))).(((.(((((....((((((.(((((((((.....(((..((((.(((..(((....))))))..))))..))).....(((((.((((((((((.(((...(((.(((((...)))))))).)))((((((((((((((((.((((((.((.((((....((((((..((((((.((((((...((((((........(((.(((((...((((....)))).))))).)))))))))..((...))..(((((((.(((((((...(.(((.(((((((...(((........)))....)))))))((.(((.((((((((..............))))))))...))).))(((((((.(((....))).)))))))........(((((....))))).....((((....)))).))).).)).)))))...)))))))((((((((((((.(((((...(.(((((.((((((...............)))))........).))))).).)).))).))))))))))))((((.......)))).....)))))).))))))..((..((.....))..)).......))))))...)))))).))).)))..(((((((((((..(((((((.((.((((.(((((...............((((((((....))))))))..(((((.............)))))(((........))).....)))))))))..)).))))))).((((((.((......(((((.((....(((((.......)))))......)))))))....)).)))))).(((((((((((((((............(((.(((((......((...))......))))).)))....)))))))))))..)))))).)))))))))..(((((....)))))...((((.....)))).))))))))............))))).)))(((((....)))))..((((..........))))..(((((((((((....(((((.(((..((....((((((((..((((((((.........))))..((.((((((((.(((((((((....)))))....(((.....))).(((((((((((.(((...(((((.(((.((...(((.((((((......((((((.(((((((...((((...((.....))...))))))))))).)))))).((((.......))))((((((((((((((.(.....((((............(((((..(((((.((((((...)))))))))))...)))))...........)))))))))))..))))))))(((((.........(((....)))............))))).....(((((((.....((((....)))).....))))))))))))).)))(((.(((((((((.((....))))))))))))))............(((((((....)))))))........(((.....)))))))).)))))..........((((.(((((..(((..............)))..))))).))))(((((((.......)))))))))).))))))....))))))))).)))))))).))...................(((((((.((((.((((((...(((...)))))))))((((....(((.......))).))))((((((((((((((.(((((((((.........)))))).........((((((((....((........((((((((.(((....))).))))))))))...)))))))).....))).)))).))))).))))).)))))))))))........))).)..))))))))....))...........)))..)))))....))))........)))))))..)))))....))))).))))).(((((((.((......)))))))))..)))))..)))).)))))))))))))).
Thermodynamic Ensemble Prediction
..(((((...((((,(((((((.(((((((..(((((({............}))))))))))))).......{{...)}))))),),...((((((((.,.{{{({(,.{|,|||{{{{,{{..(((...(({({(((((......))}}),|))),,))).,)))))},.,.},,.))))))))(((((..((((......))))...)))))..((((({{.((....)).})..))))).))))..))))).(((.(((((....((((((.(((((((((.....,{(,.((((.(((..(((....))))))..)))),,}},.....(((((.((({{{(((,,(((...(((.(((((...)))))))).,,,|(((((((((((((((.,,((((.((.((((....((((((,.((((((.((((((...((((((........(((.(((((...((({....}))).))))).)))))))))..{{...}}..(((((((.(((((({...{.(((.((((((({{.,,{{..({{{,..,})}})))},))||.(((.((((((((..,...........))))))))...))).||(((((((.(((....))).)))))),,}}.....(((((....))))}..||,{{{{....))}),))).,.)).)))))...)))))))((((((((((((.(((((...(.(((((.{(((((...............))))).,.....,).))))).).)).))).))))))))))))((((.......)))).....)))))).))))))}.{{,.({.....}}.}),.......))))))...)))))).))),}}}..,,{{(((((({{.(((((((.((.((((.(((((...............((((((((....))))))))..(((((.,,.......,,.)))))(((........)))....,)))))))))..)).)))))))}},,,((.((......,||||.,({{({((((,{{{.{{,|||||{..,{{,,|||}}....)},))))),.,,||(((((((((((.........,..(((.(((((.,,...,{}}..,......))))).)))....)))))))))))}}),))).})))))))),..(((((....)))))..}}}}}}.,..,,}}.))))))))...,........))))}.}}},((((,,..,}}},..{{{{..,,,,,,..}}))..(((((((((((....(((((.(((,.((....((((((((....(((({{.,,...(((((({({(((((...((((....(((((....)))))....)))).....,.{((.((((..((((,{{,({,....}.)).,,))))..)))).)))}})))))))))))),,{,,,{,((({,..,..,,.,{{((......)))}...(((((((.((.({...((((,........))))..)).)).))))))}..........(((((..(((((.((((({...}})))))))))...}))))}}}}}.,|,,,{{({{{..||.,,}}..||||,,...||}}..((((((((((.((..............,{....{{(({{,.|}}}.,(((((,..(((((..(((((.((((((((,..,,(((.(((((((((.((....)))))))))))))}..........,,(((((((,{,.|||||||{{{{(({{{{{.....))))}))|||...,,.,,|,{{{{({{{.,((((.(((((((.{((((..(((((.((((........))))))))).))))).))).)))).}}}}.,(({....}}}},)))},|||||,....})},,.{|{.,|{,,..,|,.}}|,,.{{.((,,((,.,,||,..)))))))))})}.....{{{.......))).}))))))).)))))..))))}.((((((.........))))))........{(.(({.{((((.(((.{....}.))).)))))}}}}))))))..|{{((|,{.(((((...,.{{{(.,....)))}..)))))))))))}..)))))))))))),,,)),))))))))))))....}}...........}))..}))))....))))........)))))))....,,..}})))))).))))).(((((((.((......)))))))))..)))),.,)))).)))))))))))))).
Forensic Context

No forensic context available.