ForensicRNA
Home
Atlas
Index
Marker Scope
|
About
Feedback
ForensicAgent
Home
Index
hsa_TTBK2_0003100
Basic Information
Symbol
hsa_TTBK2_0003100
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa-TTBK2_0183
Host gene
TTBK2
Type of circRNA
Exon-Exon
Location (GRCh37)
15:43067333-43067921
UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
15:42775135-42775723
UCSC (hg38)
External Database
circbank
Secondary Structure
Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-188.00
kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy:
-197.83
kcal/mol
Frequency:
0.0000
Diversity:
117.69
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
COPY
(..((.....((((((........(((.(((((...((((....)))).))))).)))))))))...))..)((((.((((((((((((((........(((((((...(((........)))....)))))))((.(((.((((((((..............))))))))...))).))(((((((.(((....))).))))))).((((..(.((((...((((...(((.((((....)))).)))..))))...)))))..)))).((((((((((((.(((((...(.(((((.((((((...............)))))........).))))).).)).))).))))))))))))((((.......))))..((((..((((.(((.((((..(((((((..((((((.....((.((...))))....)))))).......)))))))..)))).)))...))))..))))................((((((((....))))))))..(((((.............)))))(((........)))..)))).)))))).))))((((...))))..))))
Thermodynamic Ensemble Prediction
COPY
(..((.....((((((........(((.(((((...((({....}))).))))).)))))))))...))..)((((.((((((((((((((..,{{({{((((((({{.,.{{..(({{{...}))))))},))||.,,,.((((((((..,...........)))))))),||}|||||{((((((.(((....})}.)))))}..((((..(.((((...((((...(((.((((....)))).)))..))))...)))))..)))).((((((((((((.(((((...(.(((((.{(((((...............))))).,.....,).))))).).)).))).)))))))))))){{{{.......))))..{(((..((((.(((.((((..(((((((..(((({{.....{,,((...)))}..,.)))))).......))))))).,)))).)))...))))..)))},...............((((((((....))))))))..(((((.{,.......,,,)))))(((........)))..}))).)))))))}))){(((...))))..})))
Forensic Context
No forensic context available.