Basic Information

Symbol
hsa_TTBK2_0003800
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa-TTBK2_0106
Host gene
TTBK2
Type of circRNA
Exon-Exon
Location (GRCh37)
15:43069229-43164956 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
15:42777031-42872758 UCSC (hg38)
External Database
circbank

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-385.80 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -411.92 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 292.50
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(((((.....(((..((((..(((((((...............((((((.........))))))....(((((..((((........))))..)))))..((((((((.((((......)))).)...))))))).....(((.((.(((..((((....(((.(((.((((..(((((((((.((((((.....(((.((((.((((.......(((((..((.((((((((...)))).)))))))))))..(.((((((((....................((((((...(((((((((((...((((..((......))..)))).)))))..((((((((...))))).))).(((((.((((((((((((((((.......))))..((((((((((..(((((((.((((((....((..(((((.(((...((((((.......)))))).))))).))))))))))))))))))........((((((((.((((((((......((..(.((..((........))..)).)..)))))))))).))...)))))).)))))))))))))))))))))))))))......))))))))))))........(((.(((((((..((((..((((..(((((((((((((.....(((...((((((((...(((......))).))))))))...)))....)))))))))))))))))..................))))..)))))))...)))((.(((((........)))))))..((((((((.(((((((.((((..((((.((((.................(((((((.......(((......(((((.((.....(((((((((.....((.........))))))))))).(((((.((.(((.....((((..((((((..((((((..............))))))))))))))))...))))).)))))(((((....((((......((((((...))))))......))))....)))))(((((......)))))..)))))))......)))........))).))))(((((..((((......))))...)))))..(((((((.((....)).))..)))))....)))).)))).))))))))))))))))))))))))))).)....(((..((((.(((..(((....))))))..))))..)))...))))))))..))).....)))))).))))))))).))))))).)))...))))..))))).))))))))))...))))..)))....)))))......
Thermodynamic Ensemble Prediction
(((((.,,..(((..((((..((((((((..........,,.,{,{{{{.....,,,.||||||....,.(((((((...{((((((|,,,{{{......((((((((.((((......)))).}.,.)))))))...,,,((((((((,.....}}...|}))))).|||{,((((((((((((((,((.,{(((((.(((.{((((.,.....,}}))).}))..))))).}}))..))))).)))))))))|,((((((((.............,......((((((,..((((((.(.(((,.{(({((((..,(,,,{.{{,|.,||.,,.}})},}}|,,,,},}}}}.}||{((((.(((((((((((({(((.......)))}..((((((((((..(((((((.((((((....((..(((((.(((...((((((.......)))))).))))).))))))))))))))))))...,,,,.(((((({(.((((((((,.,...{{..(.({..{{........}}..)}.)..)})))))))),}}...)))))).}})))))))))))))))))))))))))}))}.}))))))))))))........(((.(((((((..((((..{,,...{((((((((((((..,..(((...((((((((...(((......))).))))))))...))).,..))))))))))))}|||.,,........,,.}}}}.))))..)))))))...))){{|{({{{.....,..)}}},,,..(((((((,,(((((((.((((..((((.((((,(((((,.(((...{{.(((....}},.}}..,.))).,.))))).}}.....{((((((((,....{{.........)})))))))))...,,(((.{((({,{,.{{((.(((((((..(((((({............}))))))))))))),,}....}..}}))),))).,....((((((((.,.{{{({(,.{|,|||{{{{,{{..(((...((|{{(((((......))))),,))),,))).,)))))},.,.},,.))))))))(((((..((((......))))...)))))..((((({{.((....}).})..)))))..,,)))).)))).))))))))))))))))))))))))))).}.........((((.(((..(((....))))))..)))))))..}))))))))))))))..,,,{((((...(((.(((({...)))))))).))))),,..)))))),,))))))))...))))..))).}}.)))))......
Forensic Context

No forensic context available.