Basic Information
Symbol
hsa_TTBK2_0003900
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa-TTBK2_0161
Host gene
TTBK2
Type of circRNA
Exon-Exon
Location (GRCh37)
15:43069229-43170882
UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
15:42777031-42878684
UCSC (hg38)
External Database
Secondary Structure
Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-433.10 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy:
-457.78 kcal/mol
Frequency:
0.0000
Diversity:
492.55
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(((.......)))((..((((((((((((((((((((..((((((((..((((.(((.(((...))).)))))))(((((.((.((((((((((.((.(((.(((.(((((((((..(((.(((....(((.((((.........(((((.((((((((((((((..((((((((((..((((((.........))))))....(((((..((((........))))..)))))..((((((((.((((......)))).)...)))))))........(((.((......)).)))))))))))))((((((((((((((((.((.(((((((.(((.(((((........))))).)))..))))).))))..))))).))))))))))).))))))).).)))))).)))))..)))).))).(((.(((((((..........)))))))...))).))).)))..))))))))).)))))).)).))).(((((.((((((((((((((((.......))))..((((((((((..(((((((.((((((....((..(((((.(((...((((((.......)))))).))))).))))))))))))))))))........((((((((.((((((((......((..(.((..((........))..)).)..)))))))))).))...)))))).)))))))))))))))))))))))))))...))))))).))......(((((..(((.(((((((..((((..((((..(((((((((((((.....(((...((((((((...(((......))).))))))))...)))....)))))))))))))))))..................))))..)))))))...))).)))))......(((((((((.....((..(((((((((.(((.(((........)))((((((.(((...((.(((....))).))....))).).)))))..)))..))))))))).))....)))))....))))(((.((((.....)))))))..)))))....(((((((..((((((..............)))))))))))))..))))))))..)))...........))))))).((((((((((.((((((..........((((((((((((((((....((.((((((....(((.(((((((((((......((((.(((((..((((......))))...)))))..(((((((.((....)).))..))))).......)))).....))))))))).)))))....))))))..))......))))))(((..(((....))))))....))))))...)))))))))))....((((((((...(((.(((((...)))))))).)))))..))).((((........))))))))))))))))))).))))...))
Thermodynamic Ensemble Prediction
(((.......)))((..(({(((((((((((((({((.,((((((((,.(({{.(((.(((...})}.)))}}}}{{{{{,||,|||||||{,|,|||{,{{(((.{{{(((((({{(((.(,..{{(((,.,((({{..,,.,,{{(((((((((..(((,(((.(((,,,,,,{.{{((((((.....{{{.,,,)))....(((((..((((........))))..)))))..((((((((.((((......)))).}.,.)))))))...,,.{{((({((......)).,,})))))),})}{{((((((((((((((.((.{{(((((.(({.(((({.,.....,})))).)))..))))).}}))..))))).))))))))))),)))))))}}.))),))}.,))).)))))}}))}{((.{((((((..........))))}}}.,.}}}.,}}.}}}..}}))))})),}}})),,))}}},...|||}|,,.|}}}}||}.||{|,{{{{{||{{...,,,,|||}},.{{{{{{{.{{{{{{...,((,,((((({{({...((((((.......)))))).|||||{|||}|||||||||||}}}..{((((.((((.(((({.{...{{.,,,,{(({{(.{{{{,,{{{.,{{({,.{{(,,..,.}}},,,,.})}.,},)))},,||||||.,,,,,))))})),}))))))))}}))))))))).)))}},{{{,..(((.(((((((..((((.,{{,...{((((((((((((..,..(((...((((((((...(((......))).))))))))...))).,..))))))))))))}|||.,,........,,.}}}}.))))..)))))))...))).|}||}..{...,{{,{((({...,||||,||,|{{{{{|||||{{|.,,{{.,{{(|(((((,.(((...{{.(((....},,.}}....))).}.))))).}},,..,|||||||||},..,||,.,,....,)))||||||||.....|||}}||,.|||}|,,,.(((((((..(((((({............})))))))))))))..)}}}})}}..))).},,......,|||||||.{{(((((((,,{|((((,,,..,..{{(,{,((((((((((,,....}}}||,|||},,,||,.|||||||,|{|..,}}}||||,(((((..((((......))))...)))))..((((({,.((....}).})..)))))...,}}})})),,.}}))))))))},}}))),}},}}}|||.,|},,..,.}||||}(({..(((....)))})),.}}))}}},...,,..}}}}}||,...{,,,|||,,,.{{|,|||||..,))})))}}.,}}}),}))).{|{|,,,,...,)))))))))})},))))))}.}))...))
Forensic Context
No forensic context available.