Basic Information

Symbol
hsa_chr15_0116100
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa-TTBK2_0112
Host gene
TTBK2
Type of circRNA
Intergenic-Intergenic
Location (GRCh37)
15:43069232-43102853 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
15:42777034-42810655 UCSC (hg38)
External Database

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-698.40 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -728.82 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 564.45
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(((((...........((((...((((((((((....((((..........((((((((..(((((((((.(........).))))).((((((((.....)))).))))((((((...((((((((((.(((......))).))....)))))))).(((((((.((((.((((.((((....(((((((((.......)).)))))))..(((((...((((......))))..)))))((((((((..((.((((((.............)))))).))((((((((((((...............))))).))))).)).....)))))))).((((((((((.((.((.(((.((.((.(....(((((..(((((..........((.(.((.(((....))))).).))(((((.....))))))))))..)))))....).)))).))).)).)).))))).))))).((((((((((.......))))))))))............)))).))))..))))..)))))))..((((((..((((((....(((((((..((((...........)))))))))))...((((...)))))))))).)))))).))))))((((((((((((((...((((((..((......))..)))).))....))).)))))))))))))))....))))))))))))..))))))))))..))))((((((.((((........)))).))))))((..((((......))))..))...(((((((.(((....))).)))))))(((...(((((.....((((.((((..(((((((((((.((((((((((((((..((.((((....)))).)).)))))............(((((.(((((.....(((((((((((.(....(((((((.(((((.((((((((..(.(((.(((((((.(((....))).))))).)).))))..)))).)))).........(((.(((.......))))))))))).)))))))(((((.(((.(((.((((((((((..((((..((((((((((.(((...((((..(((((.(.(((((..(((..............(((.(((((..((((((.((((.......))))))))))......))))).)))(((((((.(((((((.......))))))).)))))))...)))..))))).).)))))..))))..))).))))))...........((((((......))))))...................))))..))))))........(((((((.(((.......(((...((((.((..((((((....(((((..((..((((......((((.(.((((...((((.(((......))).))))............((((((.....)))))))))).).))))......))))..))..)))))....))))))..)).)))).))).......))).)))))))(((((((.......((((.(((.((((((........)))).))..))).)))).......)))))))...((((((((.((.((...)))).)))))))).)))))))).....(((((.(((.(.(((.((((.(((((..(((......)))..)))))))))))))))).))))).))).))).))))).(((.(((....)))...))).).))))))))))))))))....))))).........))))).)))).....((((((((((((.(((((....)))))...)).))))))))))..((....))....)))).)))))))...)))).)))))))))..))))))))...
Thermodynamic Ensemble Prediction
(((((..,,..,.,,.,.(((((((.((((((((((.(((((..((((((((((((((...))))).))}.,))))))..{(((((({(.((|||,.....{{((((({{((.((......)).)))))))).}}.{((((({(.((((((((((((.(((((((.((((.((((.((((....((((({(((((((((((((.(((..(((...........((({..{{{{{{{...,,((((((((..((,((((((.............}))))).}}({((((((((((...............))))).))))).)).....)))))))}...{{.(((((.((.,((((({..{{.((((((((.......))))))))..)}})),,)}}}..)).)))))))}..(((((((.....))))},))}))}))),..}))))))..))).))))))))).)}.}}}},.{(((((((((.......)))))))))).,))))).....)))).))))..))))..)))))))..)))))..))))))){{{{(((((((,.{(((...........)))))))))))..........{((((.((....((((((((((((((((((((((((((...((((((..((......))..)))).)),...))).))))))))))){(({(..{((((((((({{,,,(((((,(({,.,((((((((((.((((........)))).))))}|({..((((......))))..))...(((((((.(((....))).)))))))...,{{(((,,..,}}|||{{((,....}}}|{||||||,.|||||,,(((((..((.((((....)))).)).)))))...{((...{(((({,.{(({{({....,,}})))})))))...}}|,((((((((((.(,((.,,..}|.}}))),}))})),||)})))))})}))),...))))),))}.}}))),|,,,....|||||||,,,{{{{((,|,..,,,,.,.))))))})))}.{{||||,.}}}},}}})||{(({..{||||(((({.(((...((((..(((((.{,{((((..{{{...,.,||}}....{{{.(({{{..((((((.((((.....,.))))))))))......))})}.)))(((((((.(((((({.......))))))).)))))))...}}),,))))),).))}})..}}}}..}||.}||||,...........||||||,......,,,,,..........|,{....,,}|||..,,,....,,....,},..))),})))))))))).))))).||}}}}}}|}}|{,,..(((({{{(({(((((((((({(((,,,{((((,.,((((.(((......))).))))..}..))))}.,((((((.....)))))),,...{{|||.{{...{({,,..))}.)))))}}..{{{||,..}.{(({........})}},,,})))),..{{{{(((.......{{{{,{{{..,{{{{...,,,,,)))),}}..}}},||||,,,,..,||||}}|,,,((((((({,({{((,,,|||||}}}}))),..},||||}|||||(((((,((.((.(((.(((,{(((((..(((......)))..)))))))))))))),)})))))...},}}..}}))}))}}))))..,})))))))))}.,}))))))),.)}})))..,,))}))}}},}}}}.,))))),}},.....))))).)))))))))).))))))),.....|((((.((((((..,({....))..)))))).))))|((.,{{,,...,,)}.))}.....)))))...
Forensic Context

No forensic context available.